기업부설연구소 연구개발비 세액공제(25%) 사전심사 방어부터 조특법 벤처기업 인증 감면, 개발자 스톡옵션 2억원 비과세 설계, AWS/GCP 해외 클라우드 부가세 매입세액 공제, 그리고 시리즈 프리A, A 투자 실사(Due Diligence) 대비 재무제표 구축까지 — 개발 언어를 이해하는 공인회계사가 스타트업의 성장 속도에 맞춰 함께 달립니다.
테크 벤처 실시간 데이터 대사 대시보드
GitHub 커밋 로그 & 연구노트 매칭으로 국세청 사전심사 완벽 대응
해외 인보이스 부가세 대리납부 및 매입세액 적법 공제
조특법 제6조 창업중소기업 세액감면 및 벤처인증 연계로 5년간 법인세 대폭 절감
가지급금 제로화, RCPS 회계처리, 스톡옵션 주식보상비용 적법 반영
IT 스타트업은 일반 업종과 달리 소프트웨어 개발비 자산화, R&D 세액공제 사후관리, 스톡옵션 등 고도의 회계·세법 지식이 요구됩니다. 전통적 세무사 사무실에 맡겼을 때 발생하는 대표적 리스크를 짚어드립니다.
기업부설연구소 인증만 받으면 자동으로 인건비 25%가 공제되는 줄 알고 증빙을 방치했다가, 국세청 R&D 세액공제 사전심사나 현장 실사에서 연구원 실제 연구 참여 증빙(연구노트, 커밋 로그, 개발 보고서) 부족으로 수개년치 세액공제를 가산세와 함께 추징당하는 사례가 속출하고 있습니다.
조특법 제10조 상 공제 부인 + 부정과소신고가산세(40%) 및 납부지연가산세
조특법 제6조에 따른 5년간 법인세 50~100% 감면을 노리고 비과밀억제권역 공유오피스에 서류상 본점만 두고 실제 근무는 강남·판교에서 진행하다가, 국세청의 실질 사업장 현장 검증에 적발되어 감면 세액 전액 추징 및 지방세 중과세 처분을 받는 스타트업이 급증하고 있습니다.
실질과세원칙 위반 감면 박탈, 취득세 3배 중과, 5개년 법인세 소급 추징
핵심 개발자에게 부여한 스톡옵션 행사 시 조특법 제16조의2(연간 2억원 한도 비과세) 및 제16조의3(과세특례)을 적용받으려면 주총 특별결의, 중기부 보고, 특례신청서 제출 등 엄격한 절차가 필요합니다. 이를 누락하여 개발자에게 수천만 원의 근로소득세가 부과되어 퇴사로 이어지는 참사가 일어납니다.
비과세 혜택 박탈, 최고세율 45% 근로소득세 과세 및 원천징수불성실가산세
매월 수백~수천만 원씩 지출되는 AWS, Google Cloud, GitHub, OpenAI 해외 결제 시, 적격증빙(해외 신용카드 전표, B2B 사업자번호 등록 인보이스) 처리를 제대로 못 해 10% 부가가치세 매입세액 공제를 고스란히 버리거나, 부가가치세법 상 대리납부 의무를 위반하는 테크 기업이 많습니다.
연간 수천만 원 부가세 매입세액 공제 유실 및 대리납부불성실가산세(10%) 부과
자체 솔루션 구축 외주비 및 내부 인건비를 무형자산(개발비)으로 자산화할지, 당기 경상개발비로 비용 처리할지 회계기준(K-GAAP/K-IFRS)에 맞춰 명확히 분류하지 않으면, 향후 흑자 전환 시 15년간 이월 가능한 이월결손금 공제를 날리거나 감가상각 부인을 당하게 됩니다.
분식회계 논란, 세무상 이월결손금 소멸, 향후 법인세 절세 기회 영구 박탈
초기 창업자의 개인 계좌 혼용으로 누적된 대표이사 가지급금(인정이자 발생), 프리랜서(3.3%) 외주비의 원천징수 영수증 부실, 지분 변동 미신고 등은 벤처캐피털(VC) 투자 실사(Due Diligence)에서 치명적인 결격 사유가 되어 수십억 원의 투자 계약이 무산(Deal Break)됩니다.
VC 투자 유치 실패, 대표이사 상여 처분 소득세 추징, 금융기관 신용등급 하락
IT와 프로그래밍을 직접 다루는 공인회계사 이민우 대표가 기획한 전산 기장 파이프라인. 개발 용어, 깃허브 커밋, 클라우드 아키텍처를 이해하는 전문가가 차원이 다른 세무 서비스를 제공합니다.
연구개발전담부서 연구원의 인건비 세액공제(25%) 사후심사에 대비하여, 깃허브 커밋 로그, 지라 티켓, 스프린트 산출물을 연계한 표준 연구노트 및 연구개발계획서·보고서 전산 템플릿을 구축합니다. 국세청 R&D 세액공제 사전심사를 100% 무결점으로 통과시킵니다.
정평세무컨설팅의 기술 브랜드 기장팩토리.com을 통해, 토스페이먼츠, 스트라이프(Stripe), 이니시스 등 PG 결제 데이터와 AWS, GCP, GitHub 해외 인보이스를 전산 자동 파싱합니다. 외환 환차손익과 부가세 매입세액을 누락 없이 반영합니다.
혁신성장유형, 연구개발유형, 벤처투자유형 중 기업에 최적화된 벤처기업 인증 전략을 수립하고, 조특법 제6조 창업중소기업 세액감면(수도권 외 100%, 수도권 50%)과 벤처확인 연계로 5년간 수억 원의 법인세를 합법적으로 감면받는 절세 아키텍처를 설계합니다.
벤처기업 육성에 관한 특별법에 따른 주식매수선택권(스톡옵션) 규정을 검토하여, 연간 2억원 한도 비과세 특례와 양도소득세 과세특례를 완벽히 충족하도록 정관, 주총 의사록, 부여계약서를 세팅합니다. 행사 시 상증세법상 시가평가와 원천징수 신고를 일괄 지원합니다.
기관투자자(VC, 액셀러레이터)로부터 투자유치 시 실시되는 회계·세무 실사에 대비하여, 대표자 가지급금 청산, 프리랜서 원천징수 내역 정비, 상환전환우선주(RCPS) 자본/부채 분류 회계를 표준화합니다. 투자 계약 클로징이 지연되지 않도록 무결점 재무제표를 제공합니다.
개발자, 마케터, 디자이너 신규 채용 시 청년 1인당 연간 최대 1,550만원(지방 기준)까지 법인세를 감면받는 통합고용세액공제를 적용합니다. 퇴사자 발생 시 세액 추징을 방지하기 위해 3개년 상시근로자 수를 매월 모니터링하여 사후관리 리스크를 철저히 관리합니다.
SaaS 구독부터 생성형 AI 인프라, 플랫폼 중개, 모바일 앱 수출까지 각 사업 모델의 데이터 흐름에 최적화된 세무 파이프라인을 운영합니다.
월간 구독료(MRR) 및 연간 선불 결제(ARR) 시 선수수익 기간 안분 회계와 부가가치세 공급시기 일치가 핵심입니다. 연간 이용료 결제 시 결제일이 아닌 용역 제공 기간에 걸쳐 매출을 안분 인식해야 법인세 과다 납부 및 분식회계 리스크를 방지할 수 있습니다.
1. 연간 구독료 선수수익의 기간 귀속 회계와 부가가치세 세금계산서 발행 시기
2. 시험사용(Free Trial) 후 유료 전환 결제 시 결제 PG사 수수료 안분
3. 기업부설연구소 소프트웨어 업그레이드 개발비용의 R&D 세액공제 인정 범위
법인세 확정신고부터 부가가치세, 연구개발비 사전심사, 스톡옵션 보고까지 마감 시한을 놓치지 않도록 정평세무컨설팅이 선제적으로 리드합니다.
12월분 개발자 급여 및 프리랜서 외주비 원천징수 신고. 글로벌 수출 및 인앱결제 매출에 대한 영세율 첨부서류 제출 및 AWS 해외 클라우드 부가세 매입세액 확정 정산.
전 임직원 연말정산 서류 취합 및 환급 세액 산출. 전년도에 스톡옵션을 부여하거나 행사한 내역에 대해 주식매수선택권 행사명세서를 중기부 및 국세청에 의무 제출.
스타트업 1년 회계 결산의 정점. 조특법 제6조 벤처감면(50~100%) 및 제10조 R&D 세액공제(25%) 정밀 반영. 결손금 소급공제 환급 또는 15년 이월결손금 등록.
1분기 부가가치세 예정신고 및 법인세 과세표준의 10%를 납부하는 법인지방소득세 신고·납부 완료. 벤처기업 인증 갱신 일정 및 지분 변동 공시 점검.
개인사업자 스타트업 대표님의 종합소득세 신고. 법인 스타트업 대표이사의 근로소득 외 금융소득·배당소득 종합과세 검토 및 스톡옵션 양도소득세 신고.
상반기(1~6월) 재무제표 중간 결산. 국세청에 연구인력개발비 세액공제 적격성을 미리 검증받는 R&D 세액공제 사전심사를 신청하여 세무조사 추징 리스크를 선제 해소.
상반기 부가가치세 확정신고. 대규모 서버 장비 구축이나 소프트웨어 개발 시설투자가 발생한 경우 15일 이내 조기환급을 신청하여 회사 자금 런웨이 확보.
전년도 법인세액의 1/2을 중간예납하거나, 상반기 실적을 가결산하여 실제 세액으로 납부. 상반기 적자가 발생했거나 벤처감면을 새로 받는 경우 가결산 방식으로 세금 0원 납부 가능.
하반기 IR 및 시리즈 투자 라운드 오픈에 대비하여 주주명부, 정관, 가지급금 잔액, 임직원 근로계약서, 스톡옵션 부여 한도(발행주식 총수의 10~50%) 전수 점검.
3분기 부가가치세 예정신고. 연말 도래 전 청년 인재 채용에 따른 통합고용세액공제 인원 요건 충족 현황을 점검하여 연말 추가 채용 전략 수립.
1~10월 실적을 토대로 당해 연도 법인세액을 사전 시뮬레이션하고, 연구개발비 지출 시점 조율, 클라우드 비용 정산, 서버 장비 구매 스케줄을 확정 짓는 핵심 골든타임.
당해 연도 R&D 연구과제별 연구노트 최종 마감 및 서명 날인 완료. 상시근로자 수 확정, 대표이사 및 임직원 퇴직연금 불입 완료, 가지급금 전액 회수 정리.
현재 우리 회사의 세무 관리와 R&D 세액공제 증빙 상태를 직접 체크해보세요. 점수에 따라 국세청 기획검증 위험도와 맞춤 개선 처방이 즉시 산출됩니다.
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정평세무컨설팅과 함께 세무 리스크를 방어하고 수억 원의 절세와 투자 유치에 성공한 테크 벤처들의 실제 성공 사례입니다. (비밀보호를 위해 고객사 정보는 가명 처리되었습니다.)
[진단 전 상황] 개발자 12명을 고용 중이나 기존 세무대리인이 "연구소 세액공제는 세무조사 나온다"며 3년간 한 번도 공제를 신청하지 않아 막대한 세액을 과다 납부함.
[정평 솔루션] 코딩하는 회계사 이민우 대표가 직접 Git 커밋 로그와 지라 스프린트 이슈를 분석하여 3개년 연구과제 보고서를 전산 구축하고, 국세청 R&D 사전심사를 신청하여 1억 4천만원을 환급받음.
[진단 전 상황] 흑자 전환 후 법인세 부담이 급증하고 핵심 개발진의 스톡옵션 행사에 따른 소득세 폭탄 우려로 핵심 인력 이탈 위기에 봉착함.
[정평 솔루션] 기술보증기금 혁신성장유형 벤처인증 취득을 리드하여 5년간 법인세 50% 감면을 확보하고, 조특법 제16조의2 스톡옵션 비과세(2억원) 적격 계약서 및 특례신청서를 완비하여 인력 이탈을 방어함.
[진단 전 상황] 해외 앱스토어 인앱결제 매출과 국내 결제분이 혼재되어 국세청으로부터 부가가치세 과소신고 해명 안내문을 수령하고 서버비 환급이 묶임.
[정평 솔루션] 기장팩토리 전산 엔진으로 구글·애플 글로벌 결제 리포트를 국가별로 역산 대사하여 외화획득 용역 영세율을 100% 입증하고, 묶여 있던 부가세 8,500만원을 15일 만에 조기환급 입금시킴.
[진단 전 상황] 초기 사업 운영 과정에서 대표이사 개인 지출과 법인 자금이 혼용되어 가지급금 2억 3천만원이 누적되어 리드 투자사 실사에서 딜 브레이크 위기 발생.
[정평 솔루션] 정평세무컨설팅 회계사팀이 2주간 긴급 실사 대응팀을 가동하여 대표이사 특허권 양수도 및 직무발명보상금을 활용해 합법적으로 가지급금을 전액 청산하고 클린 재무제표를 완성함.
국세청은 최근 기업부설연구소 R&D 세액공제와 청년창업감면을 적용받은 테크 기업에 대해 기획 세무검증을 대폭 강화했습니다. 조사 개시 전 반드시 점검해야 할 핵심 수칙입니다.
정기 세무조사인지, R&D 연구소 사후점검 통보 또는 탈세제보에 의한 비정기 조사인지 파악하고 조사 대상 과세기간(통상 최근 3~5년)을 확인합니다.
투자 유치 클로징, 해외 론칭, 핵심 인력 사고 등 정당한 사유가 있을 시 국세기본법 제81조의6에 따라 세무조사 개시 전 공식 연기신청을 진행합니다.
연구전담요원의 졸업증명서, 자격증, 연구노트, 깃허브 커밋 기록, 소스코드 버전 이력을 정리하여 비연구 업무(영업/CS) 겸직 의혹을 원천 차단합니다.
비과밀억제권역 본점의 실제 임대차계약서, 임대료 지급 내역, 출퇴근 기록, IP 접속 로그를 구비하여 서류상 본점(페이퍼컴퍼니) 의혹을 사전에 방어합니다.
프리랜서 및 외주 개발사에 지급한 비용의 용역계약서, 산출물 화면 캡처, 검수확인서를 편철하여 가공 용역비 계상 의혹을 완벽히 해명합니다.
해외 클라우드 인보이스의 실제 개발 서버 사용 내역과 결제 전표를 일치시켜 매입세액 공제의 정당성을 입증합니다.
장부상 대표자 대여금 잔액에 대한 인정이자 계산 및 상여처분 세액을 사전에 파악하고 대여자금의 업무 관련성을 소명합니다.
주총 의사록, 중기부 행사 보고서, 특례신청서 접수증 사본을 구비하여 비과세 2억원 적용의 적법성을 즉시 제시합니다.
조사관과의 모든 질의응답 및 서류 제출 창구를 세무대리인(공인회계사)으로 단일화하여 불필요한 구두 진술로 인한 과세를 예방합니다.
세무조사 종결 후 부당한 과세 항목에 대해 세무조사 결과통지서 수령 30일 이내에 국세청 과세전적부심사를 청구하여 권리를 구제받습니다.
법인 설립 초기 정관 작성부터 주주 간 계약, 벤처인증까지 초기에 세팅하지 않으면 수억 원의 세금을 낭비하게 됩니다.
상법 및 벤처기업법 상 스톡옵션 부여 한도(10~50%), 중간배당, 임원 퇴직금 지급 규정을 법인 설립 정관에 사전에 완비해야 추후 법인세 손비 인정이 가능합니다.
대표자 만 15~34세 해당 시 수도권 과밀억제권역 외 지역(용인, 화성, 송도, 판교 인접 비과밀 등) 설립 시 5년간 법인세 100% 감면 혜택의 실근무 요건을 검토합니다.
공동창업자 간 4년 근속 베스팅(1년 클리프) 및 주식 양도 제한 조항을 세팅하고, 향후 지분 이동 시 양도소득세 및 증여세 이슈를 사전에 차단합니다.
한국산업기술진흥협회(KOITA) 인증 연구소를 초기 설립하여 개발자 채용 첫 달부터 인건비 25% R&D 세액공제를 받을 수 있도록 인적·물적 요건을 세팅합니다.
창업 3년 이내 벤처인증 취득 시 조특법 제6조에 따라 5년간 법인세 50% 감면, 취득세 75% 감면, 재산세 감면 혜택을 극대화합니다.
기장팩토리 API를 통해 AWS, Stripe, 카드사 결제 데이터를 연동하여 결제 누락과 부가세 불공제 오차를 첫날부터 제거합니다.
법인 설립일부터 대표이사 가지급금 발생을 원천 차단하고, 분기별 재무제표 결산 리포트를 발행하여 VC 실사 프리패스 환경을 구축합니다.
빠른 속도와 정확성이 생명인 IT 스타트업을 위해 고도화된 5단계 전산 파이프라인을 운영합니다.
수익 모델(SaaS, 중개, 개발용역), 연구원 구성, 스톡옵션 부여 현황 및 과거 세무신고서 정밀 진단.
GitHub 커밋 로그 및 Jira 티켓 기반 연구원별 참여율 전산 매핑 및 R&D 세액공제 적격성 확립.
Stripe, 토스 결제 데이터 및 AWS, GCP 해외 인보이스 자동 수집·회계 전표화 파이프라인 가동.
벤처감면, 고용세액공제, R&D 공제액 산출 및 8월 법인세 중간예납, 11월 4분기 사전 절세 미팅 진행.
3월 법인세 확정신고 완료, 조특법 감면 신청서 완비, VC 투자유치 시 회계 실사 전담 질의응답 대응.
정평세무컨설팅은 세무사법에 따라 불법적인 호객 행위, 객관적 근거 없는 독점적·최상급 표현, 단독 금액 낚시성 광고를 일체 배제하며, 오직 구체적인 기술적 업무 범위와 회계 난이도에 근거한 합리적 보수 기준표를 운영합니다.
※ 본 기준은 개인사업자 창업 기업에 적용되며, 법인사업자 대상 가격 표시는 하지 않습니다.
연간 수입금액 구간과 결제 PG사 거래 건수, 인앱결제 정산 볼륨에 따라 표준 기장 보수가 차등 산정됩니다.
연구전담요원 인건비 공제 대상 인원수와 연구노트 검증, 국세청 사전심사 대행 여부에 따라 자문 범위가 결정됩니다.
AWS, GCP 달러 인보이스 처리, 해외 매출 영세율 첨부서류 매핑 및 외국환거래법 자문 범위가 반영됩니다.
스톡옵션 부여 인원, 비과세 특례 신청, 개발 프리랜서(3.3%) 원천징수 대상자 수에 맞춰 최적 견적이 책정됩니다.
시리즈 A 이상 대규모 기관 투자유치, 해외 법인(플립) 지분 구조 변경, 복합 스톡옵션 시가평가 등 영세한 범위를 넘어서는 특수 케이스는 기업 세무 상태 및 회계 구조 정밀 진단 후 별도 협의 필요합니다.
테크 스타트업 실무 현장에서 매일 부딪히는 핵심 세무·회계 의문점들을 공인회계사의 시각에서 명쾌하게 풀어드립니다.
스타트업의 시간은 자본입니다. 접수 즉시 테크 전문 회계사가 배정되어 신속하게 연락드립니다.
IT 스타트업·SaaS 대표님 전용 직통 접수처
R&D 세액공제, 벤처인증 감면, 스톡옵션 비과세, 클라우드 부가세 공제 등 현재 고민이신 사항을 남겨주시면 담당 회계사가 직접 검토 후 유선 연락드립니다.
VC, 액셀러레이터, 창업보육센터, 개발 에이전시 전용
포트폴리오사 단체 세무 자문, 벤처인증 연계 패키지, 개발사 외주 세무 협력 등 정평세무컨설팅과 함께할 B2B 협력 모델을 제안해 주세요.
정평세무컨설팅을 만나 R&D 세액공제와 세무 리스크에서 해방된 테크 창업가들의 솔직한 이야기입니다.
"개발자 출신 회계사님이라 말이 통합니다. Git 커밋 로그와 스프린트 문서를 보시더니 연구개발비 보고서를 순식간에 구조화해 주셔서 R&D 세액공제 8,000만원을 무사히 환급받았습니다."
"AWS 달러 결제랑 스트라이프 결제 정산이 매달 골칫거리였는데, 기장팩토리 전산 엔진으로 연동하니 오차 0원으로 장부가 정리됩니다. 개발팀 야근이 사라졌습니다."
"시리즈 A 투자 실사에서 VC 측 회계법인이 가지급금과 외주비 문제를 집요하게 파고들었는데, 이민우 회계사님이 전면에 나서서 완벽하게 방어해 주셔서 40억 투자 유치에 성공했습니다."
"핵심 개발자들에게 스톡옵션 줄 때 세금 문제를 명확히 풀어준 곳은 정평이 유일했습니다. 2억원 비과세 특례 절차를 완벽히 밟아주셔서 핵심 인력들을 지킬 수 있었습니다."
정평세무컨설팅 대표 / 기장팩토리 개발자
대한민국 공인회계사로서 수많은 스타트업, 벤처기업의 회계감사와 가치평가를 수행하며, 전통적인 수기 세무 대리가 빠른 테크 기업의 성장 속도를 따라가지 못하는 현실을 바꾸고자 직접 코딩을 시작했습니다.
파이썬 기반의 데이터 자동 수집 및 결제 대사 엔진을 직접 개발하여 전산 기장 플랫폼 기장팩토리(Gijang Factory)를 론칭했습니다. 정평세무컨설팅은 복잡한 IT 비즈니스를 누구보다 깊이 이해하는 테크 특화 회계 파트너입니다.