정평세무컨설팅 MEDICAL CLINIC & MSO TAX
현대적인 종합병원 병의원 진료실 배경
피부과 · 성형외과 · 치과 · 안과 · 한의원 · MSO 전문 세무 자문

비급여 과세 안분과 페이닥터 네트급여, 의료 회계의 엄격함이 원장님의 자산을 지킵니다

비보험 과세 vs 건보 급여 면세 정밀 안분, 봉직의 네트제 Gross-up 역산 및 4대보험 리스크 차단, 고가 의료장비 조특법 제24조 투자세액공제(최대 12%), MSO 병원경영지원회사 설립까지. 빅4 EY 한영 회계법인 감사본부 출신 이민우 공인회계사가 무결점으로 방어합니다.

병의원 맞춤 세무 진단 신청 네트급여 & MSO 절세 계산기
VAT RECONCILIATION
과세·면세 겸영 안분
공통매입세액 100% 정합
NET PAYROLL SYSTEM
봉직의 네트급여
원천세·퇴직금 분쟁 차단
TAX CREDIT ART. 24
의료기기 세액공제
도입액 최대 10~12% 공제
MSO CONSULTING
병원경영지원 MSO
실효세율 8.8% 합법 설계
병의원 세무 경고

의원·치과·한의원 원장님이 가산세와 세무조사 직격탄을 맞게 되는 6대 원인

병의원은 국민건강보험공단 급여 자료, 신용카드 결제 내역, 현금영수증 및 비급여 진료비가 국세청 빅데이터에 실시간 대사되는 고위험 세무 관리 업종입니다.

01

비급여 과세 vs 보험급여 면세 안분 오류 및 부가세 추징

피부 미용, 성형수술, 치아교정/미백, 라식 등 부가가치세 과세 대상 비급여 진료와 치료 목적 면세 진료가 혼재된 의원은 공통매입세액(임차료, 인테리어, 의료장비 리스료 등) 안분 계산이 매우 까다롭습니다. 단순 임의 안분 시 수천만 원의 부가세와 가산세가 추징됩니다.

과·면세 안분 오류 시 매입세액 추징 및 가산세
02

페이닥터 네트제(Net) 계약 원천징수 Gross-up 누락

봉직의(페이닥터)의 세후 실수령액을 보장하는 네트제 계약 시, 병원이 대납해 준 근로소득세와 4대보험료를 총급여(Gross)로 역산하지 않고 축소 신고하는 관행이 팽배합니다. 국세청 감사 시 원천징수 불성실가산세 및 4대보험료 수억 원이 소급 고지됩니다.

네트 대납분 역산 누락 시 근로소득세 소급 추징
03

수억 원대 고가 의료기기 투자세액공제(최대 12%) 전액 누락

레이저, 초음파, CT, 파노라마, 덴탈체어 등 고가 의료장비는 조특법 제24조 통합투자세액공제 대상입니다. 하지만 일반 세무사들은 리스 장비라는 이유로 또는 요건 검토를 기피하여 수천만 원에 달하는 세액공제 혜택을 청구조차 하지 않고 날려버립니다.

조특법 제24조 공제 누락으로 수천만 원 세금 과다 납부
04

연매출 5억 초과 성실신고확인대상 진입 & 기획 세무조사 위기

보건업(병의원)은 연매출 5억 원을 초과하면 즉시 성실신고확인대상자로 지정됩니다. 의약품·소모품 사입 내역, 전자차트 수기 수정 내역, 현금 할인 시술 등이 전자신고 분석 시스템에서 포착되면 세무조사 우선 대상자로 선정되어 진료실에 국세청 조사관이 들이닥칩니다.

전자차트 vs 수입금액 불일치 세무조사 위험
05

부실 MSO(병원경영지원회사) 운영에 따른 부당행위계산부인

개인소득세 최고세율 49.5%를 피하기 위해 가족 명의로 MSO 법인을 설립해 과도한 수수료를 송금했다가, 실체 없는 페이퍼컴퍼니로 적발되어 법인세·종합소득세 추징은 물론 의료법 위반(사무장병원 오인) 리스크까지 직면하는 사례가 속출하고 있습니다.

실질 없는 MSO 용역비 전액 손금 부인 및 세무조사
06

매년 5월/6월 종합소득세 신고철 수백만 원 기습 세무조정료

평소에는 월 기장료만 받다가, 5월 종소세 신고와 6월 성실신고확인 시즌이 되면 병의원의 매출 규모와 봉직의 인원수를 핑계로 수백~수천만 원의 세무조정료를 기습 청구하여 원장님의 자금 운영 계획을 흔드는 불투명한 관행이 반복되고 있습니다.

불투명한 수수료 체계로 예측 불가능한 자금 유출
정평세무컨설팅 특화 솔루션

의료 실무와 세법을 완벽히 융합한 정평 6대 병의원 세무 엔지니어링

EY 한영 회계법인 감사본부 출신 이민우 공인회계사의 엄격한 회계 감사 노하우와 스마트 세무 자동화 플랫폼 기장팩토리 기술이 원장님의 병원을 가산세와 세무조사로부터 100% 방어합니다.

SOL 01. VAT & TAX-EXEMPT RECONCILIATION

비급여 과세 vs 보험급여 면세 정밀 안분 & 공통매입세액 공제

피부 미용, 성형수술, 치아교정/미백 등 부가가치세 과세 대상 비급여 수입과 건보공단 요양급여 면세 수입을 1원 단위까지 전산 안분합니다. 병원 인테리어, 임차료, 의료 소모품비의 공통매입세액 안분 계산식을 최적화하여 불공제 매입세액을 최소화하고 정당한 환급을 전액 확보합니다.

과·면세 안분율 전자차트 연동 1:1 대사
공통매입세액 합법적 환급 극대화
SOL 02. NET PAYROLL COMPLIANCE

봉직의(페이닥터) 네트제 표준 계약 & Gross-up 원천세 전산화

봉직의 실수령액 보장(Net 계약)에 따른 소득세·4대보험 대납액을 세법상 정당한 총급여(Gross-up)로 역산하여 원천징수 불성실가산세를 원천 차단합니다. 퇴직금 포함 여부와 연말정산 환급금 귀속 주체를 명문화한 표준 네트 계약서를 정비하여 노무 분쟁을 완벽히 방어합니다.

네트 급여 역산 대납 세액 전액 경비 인정
노무 분쟁 방어 퇴직금 소급 청구 0원화
SOL 03. MEDICAL DEVICE TAX CREDIT

레이저·CT·초음파·덴탈체어 조특법 제24조 투자세액공제(최대 12%)

병원에 신규 도입한 고가 레이저, CT, MRI, 초음파, 치과 체어, 한방 물리치료 장비 등 사업용 기계장치에 대해 조특법 제24조 통합투자세액공제를 적용합니다. 투자금액의 10%(추가분 합산 최대 12~13%)를 종합소득세 또는 법인세에서 직접 차감하여 수천만 원의 세금을 즉시 절감합니다.

의료장비 공제 도입액의 10~12% 직접 차감
이월 공제 관리 향후 10년간 이월 공제 완비
SOL 04. MSO INCORPORATION & GOODWILL

합법적 MSO(병원경영지원회사) 설립 & 브랜드 영업권 평가 절세

개인 원장님의 최고세율 49.5% 구간 소득을 MSO 법인(법인세율 9~19%)으로 합법 분산합니다. 의료기기 렌탈, 의약품·소모품 공동구매, 마케팅 자문 등 실질 용역을 구비하여 부당행위계산부인을 완벽 차단하고, 병원 브랜드 가치를 영업권으로 감정평가(실효세율 8.8%)하여 수억 원을 합법 절세합니다.

MSO 법인 설계 소득 분산 실효세율 인하
브랜드 영업권 기타소득 8.8% 저율 과세
SOL 05. AUDIT DEFENSE & DUE DILIGENCE

연 5억 초과 성실신고확인 사전 검증 & 기획 세무조사 입회 방어

연매출 5억 원을 초과하는 성실신고확인대상 병의원을 위해 12월 결산 전 전표와 전자차트 수기 수정 내역을 사전 감사(Due Diligence)합니다. 의약품 수불부와 실제 투약 내역의 정합성을 확보하여 국세청 PCI(재산·소비·소득) 시스템 분석 및 병의원 기획 세무조사를 무결점으로 방어합니다.

성실신고 사전감사 연 5억 초과 무결점 소명
세무조사 방어 조사관 직접 입회 대응
SOL 06. TRANSPARENT PRICING MODEL

사전 합의 정액제 세무 구독 (스탠다드 플랜 5월 조정료 0원)

정평세무컨설팅의 병의원 스탠다드 플랜은 매월 복식부기 기장 대행뿐만 아니라 1·7월 부가가치세 확정신고, 12개월 봉직의 원천세 신고 및 5월 종합소득세 세무조정료까지 모두 포함된 올인원 정액제입니다. 5월 신고철에 수백만 원의 조정료를 기습 청구하지 않아 투명한 자금 운용이 가능합니다.

5월 세무조정료 스탠다드 플랜 기본 포함(0원)
투명한 기준 진료과목·매출별 사전 합의
인터랙티브 세무 시뮬레이터

우리 병의원의 의료기기 세액공제 & MSO 절세 계산기

연간 병의원 총매출, 비급여(과세) 비중, 의료장비 신규 투자액, 소속 봉직의(페이닥터) 수를 입력하시면 정평 솔루션 적용 시 세제 혜택을 즉시 계산해 드립니다.

만 원 (15억)

건보공단 요양급여 + 환자 본인부담금 + 비급여 시술비 합산 총액

피부미용, 성형수술, 치아교정/미백 등 부가세 10% 과세 대상 비중

만 원 (1억)

조특법 제24조 통합투자세액공제 대상 신규 도입 의료기기 총액

명

네트제(Net 계약)로 세후 실수령액을 보장받는 소속 진료의사 수

CLINICAL TAX DIAGNOSTIC REPORT

병의원 절세 및 노무 리스크 진단 결과

조특법 제24조 & 소득세법 기준
의료기기 투자세액공제(10%) 10,000,000 원 소득세 직접 세액차감
공통매입세액 안분 추가환급 8,000,000 원 과세매출 대응 부가세 환급
네트급여 리스크 방어액 약 24,000,000 원 원천세 대납분 경비화 및 가산세 방어
정평 MSO 및 특화 솔루션 적용 시 총 세제 혜택 추정치
약 87,000,000 원
의료기기 투자세액공제 + 매입세액 환급 + 네트급여 리스크 방어 + MSO 과세표준 분산 절세 합산 추정
1:1 맞춤 세무 진단 접수
원장님 3분 자가진단

우리 병의원 세무 리스크 & 절세 건전성 자가진단 10선

3개 이상 해당된다면 현재 과·면세 안분 오류로 인한 부가세 추징, 페이닥터 네트급여 세무 리스크, 의료기기 투자세액공제 누락 등 심각한 위험에 노출되어 있을 가능성이 높습니다.

CHECK 01

피부 미용, 성형, 치아교정 등 비급여 과세 진료와 보험급여 면세 진료를 겸영하면서 공통매입세액 안분을 정밀하게 대사하지 않고 있다.

위험: 세무조사 시 공통매입세액 안분 오류로 인한 부가가치세 본세 및 과소신고가산세 추징

CHECK 02

봉직의(페이닥터)에게 세후 실수령액을 보장하는 네트제(Net 계약)를 적용하면서, 대납한 소득세와 4대보험료를 Gross-up 역산하지 않고 축소 신고했다.

위험: 원천징수 불성실가산세(최대 10%) 및 과거 3개년 4대보험료 대량 소급 고지

CHECK 03

수천만~수억 원을 들여 레이저, 초음파, CT, 덴탈체어를 신규 도입했음에도 조특법 제24조 통합투자세액공제를 한 번도 신청하지 않았다.

위험: 의료장비 투자금액의 최대 10~12%에 달하는 수천만 원의 세금 감면권 영구 상실

CHECK 04

연매출이 5억 원을 초과하여 성실신고확인대상자가 되었음에도 전자차트 수정 이력이나 의약품 수불부 사전 검증 없이 일반 장부로 신고했다.

위험: 산출세액의 5% 성실신고 미확인 가산세 및 국세청 기획 세무조사 우선 선정

CHECK 05

개인소득세 최고세율(49.5%)을 낮추기 위해 MSO(병원경영지원회사)를 운영하고 있으나, 실제 용역 제공 증빙과 적정 가격 산정 근거가 없다.

위험: 국세청 세무조사 시 부당행위계산부인 적용으로 수수료 전액 손금 불인정 및 세금 폭탄

CHECK 06

병원 인테리어 공사비와 샴푸실/수술실 배관 설비 비용에 대한 감가상각 내용연수 단축(기준 내용연수의 75% 적용)을 활용하지 않았다.

위험: 개업 1~3년 차 높은 소득세 부담을 조기에 경감시킬 절세 기회 상실

CHECK 07

제약사 및 의료기기 유통사로부터 수취한 전자세금계산서와 실제 입고된 의약품·소모품 수불부의 수량이 일치하지 않는다.

위험: 가공경비 계상 혐의로 국세청 포탈 조사 및 리베이트 연계 기획조사 직격탄

CHECK 08

건당 10만 원 이상 비급여 시술 결제 시 환자가 현금영수증 발행을 원하지 않는다고 하여 자진 발급을 누락하고 있다.

위험: 미발급 금액의 20%에 달하는 현금영수증 미발급 가산세 부과

CHECK 09

매년 5월 종합소득세 신고 및 6월 성실신고확인철마다 담당 세무사로부터 수백만 원의 세무조정료 청구서를 갑작스럽게 받고 있다.

위험: 예측 불가능한 자금 유출로 병의원 현금 흐름 악화

CHECK 10

병의원 특유의 과·면세 겸영 회계나 페이닥터 네트제 노무 실무 경험이 없는 일반 세무사에게 맡겨 의료 특화 혜택을 놓치고 있다.

위험: 비전문 세무 대리로 인한 가산세 발생 및 과다 납부 세액 방치

우리 병의원 세무 취약점 정밀 진단받기
차별화 전문성 비교

일반 세무 대리와 정평 병의원 특화 세무의 차이

과·면세 안분 계산 능력과 페이닥터 네트제 노무 설계, MSO 실체성 구축의 깊이 차이가 원장님의 수천만 원 세금과 세무 안전성을 결정합니다.

비교 항목 일반 비전문 세무사 정평세무컨설팅 (병의원 특화)
비급여 과·면세 안분 단순 추정 비율로 신고 (공통매입세액 안분 오류로 부가세 추징) 전자차트 연동 1원 단위 정밀 안분 및 공통매입세액 합법 환급 극대화
봉직의 네트급여 관리 실수령액 기준 단순 신고 (원천세 대납분 경비 부인 및 가산세) 세법상 정당한 Gross-up 역산 산식 명문화 및 퇴직금 분쟁 원천 방어
의료기기 투자세액공제 리스 장비라는 이유로 조특법 제24조 세액공제 전액 누락 운용/금융리스 정밀 검토로 조특법 제24조 통합투자세액공제(최대 12%) 직접 차감
MSO(경영지원회사) 설립 페이퍼컴퍼니 형태 단순 방치 (부당행위계산부인 적발 세금 폭탄) 기기 렌탈·구매대행·자문 실체성 구축 & 브랜드 영업권 평가(실효세율 8.8%) 절세
성실신고확인 및 조사대응 형식적 확인서 발급 (국세청 병의원 기획조사 선정 시 무방비) 결산 전 사전 감사(Due Diligence) 및 조사관 직접 입회 무결점 소명
5월 세무조정료 신고철 수백만 원 기습 추가 청구 (원장님 자금 계획 혼란) 스탠다드 플랜 기본 포함 (5월 추가 청구 0원, 사전 합의 정액제)
실제 자문 성공 사례

과·면세 안분과 MSO 설계로 검증된 병의원·의료기관 절세 실적

비급여 공통매입세액 환급부터 페이닥터 네트제 리스크 차단, 의료기기 세액공제, MSO 영업권 평가까지 정평세무컨설팅이 직접 해결한 실제 성공 사례입니다.

CASE 01 : 강남 신사동 대형 피부과의원 (연매출 28억 원, 봉직의 3인)

비급여 과세·면세 진료 정밀 안분으로 매입세액 3,600만 원 추가 환급 및 세무조사 방어

매입세액 환급액 3,600만 원 환급
기존 문제점

피부미용 시술(과세)과 여드름·아토피 치료(면세)가 혼재되어 있었으나, 기존 세무사가 공통매입세액을 면세 비율로 과다 산정하여 지난 3년간 부가세 3,600만 원을 환급받지 못함.

정평의 솔루션

전자차트 시술 코드와 결제 데이터를 전수 연동하여 실제 과세 진료에 사용된 레이저실 장비, 임차료, 소모품의 실지귀속을 완벽 분리하고 경정청구 진행.

최종 성과

누락된 매입세액 3,600만 원을 전액 현금으로 환급받았으며, 국세청 공통매입세액 사후검증을 무결점으로 소명 종결함.

CASE 02 : 서초 반포 임플란트 전문 치과의원 (체어 8대, 연매출 18억 원)

3D CT 및 덴탈체어 1억 2천만 원 조특법 제24조 투자세액공제(1,200만 원) 및 조기환급

초기 유동성 확보 2,400만 원 확보
기존 문제점

최신 3D 구강 CT 1대와 덴탈체어 4대를 금융리스로 신규 도입했으나 기존 세무사가 리스는 세액공제 대상이 아니라고 오인하여 공제 신청을 전액 누락함.

정평의 솔루션

세법상 금융리스의 자산 등재 규정을 적용하여 조특법 제24조 통합투자세액공제(10%) 1,200만 원을 소득세에서 직접 차감하고 장비 부가세 1,200만 원 조기환급 신청.

최종 성과

총 2,400만 원의 실질적 세제 혜택을 조기 확보하여 원장님의 고가 의료장비 리스료 월 부담을 대폭 경감시킴.

CASE 03 : 분당 판교 척추관절 정형외과의원 (봉직의 4인, 연매출 35억 원)

봉직의 4인 네트제 계약 Gross-up 전면 정비로 원천세·4대보험 소급 추징 7,200만 원 방어

소급 추징 방어액 7,200만 원 차단
기존 문제점

봉직의 4인에게 월 세후 실수령 1,500만 원을 보장해 주면서 소득세 대납분을 비과세로 처리했다가 국세청 및 건보공단으로부터 7,200만 원 추징 통보를 받음.

정평의 솔루션

세법상 Gross-up 역산 산식을 적용하여 과거 대납 세액을 정당한 인건비 총급여로 재분개하고, 퇴직금 분쟁을 원천 차단하는 표준 네트 계약서로 전면 교체.

최종 성과

대납 세액의 전액 경비 인정을 입증하여 소급 추징금을 0원으로 전액 방어하고 봉직의와의 퇴직금 분쟁 소지를 영구 해소함.

CASE 04 : 서울 송파 잠실 한방병원 (연매출 24억 원)

합법적 MSO 법인 설립 및 병원 브랜드 영업권 평가(4억 원)로 5년간 2억 1천만 원 절세

5개년 누적 절세액 2억 1,000만 원
기존 문제점

연매출 24억 원으로 종합소득세 최고세율 49.5% 구간에 도달하여 매년 2억 원 이상의 막대한 소득세가 발생하고 성실신고 위험에 노출됨.

정평의 솔루션

원외탕전실 및 한약재 유통 MSO 법인을 설립하고 병원 브랜드 가치와 환자 관리 시스템을 4억 원으로 감정평가하여 영업권 양도 계약 체결.

최종 성과

대표원장은 영업권 대금을 실효세율 8.8%로 절세 수령하고 MSO 법인은 매년 8천만 원씩 감가상각(손금)하여 5년간 2억 1천만 원을 합법 절세함.

CASE 05 : 수원 광교 안과의원 (노안/백내장 수술, 연매출 22억 원)

전자차트 수술 내역과 인공수정체 렌즈 수불부 1:1 전산 대사로 가공경비 의혹 무결점 소명

가산세 방어 성과 가산세 0원 종결
기존 문제점

국세청으로부터 백내장 다초점 인공수정체 렌즈 매입액 대비 비급여 수술 수입금액 비율이 낮다는 이유로 매출 누락 혐의 해명 요구서를 받음.

정평의 솔루션

기장팩토리 전산 엔진으로 EMR 전자차트 수술 기록, 파손/불량 렌즈 폐기 대장, 세금계산서 입고 데이터를 1:1 매칭한 수불 소명서 제출.

최종 성과

세무서로부터 전수 정합성을 인정받아 매출 누락 혐의를 완전히 벗고 가산세 0원으로 조사를 완벽 종결함.

세무사법 광고규정 준수 수수료 산정 기준

5월 세무조정료 기습 청구 없는 병의원 투명 정액제 세무 구독 모델

정평세무컨설팅은 금액 단독 노출을 엄격히 배제하며, 진료과목, 연간 총매출 규모, 소속 봉직의 및 간호인력 수, 비급여 과세 비율, MSO 법인 유무에 따라 객관적으로 사전 협의합니다.

SOLO CLINIC 1인 원장

1인 의원·치과·한의원

봉직의 없이 원장님 1인이 운영하는 단독 의원, 치과의원, 한의원 (연매출 5억 원 이하 표준 개인사업자 기준).

표준 복식부기 장부 및 전표 기장
1·7월 부가가치세 및 2월 사업장현황신고
간호인력 원천세 및 4대보험 취득/상실 신고
진료과목·매출규모 기반 사전 협의
5월 세무조정료는 별도 기준표 적용
산정 기준 상담 문의
MOST POPULAR - 정액제 완비
STANDARD ALL-IN-ONE 의원 표준

스탠다드 올인원

봉직의 1인 이상, 비급여 과·면세 겸영 클리닉 (매출규모별 사전 협의 정액제).

연간 세무조정료 기본 포함 (5월 0원)
비급여 과세 vs 보험급여 면세 정밀 안분 계산
봉직의(페이닥터) 네트제 표준 계약 & Gross-up 원천세
의료기기 조특법 제24조 투자세액공제(최대 12%) 반영
1·7월 부가세 + 매월 원천세 + 연간조정 올인원
스탠다드 정액 요율 신청
HOSPITAL & MSO 병원·MSO

병원급 & MSO 법인

연매출 5억 원 초과 성실신고 대상 의원, 병원급 의료기관, 네트워크 지점 및 MSO 병원경영지원회사.

성실신고확인 사전감사 & 무결점 소명
합법적 MSO 법인 설립 및 브랜드 영업권 평가
국세청 병의원 기획 세무조사 입회 및 포탈 방어
의료기기 렌탈 및 의약품 구매대행 정합성 검증
영세 범위 초과 특수 케이스: 별도 협의 필요
B2B 제휴 및 맞춤 견적 협의

세무사법 및 광고규정 준수 안내

본 수수료 안내는 의료기관의 진료과목, 연간 총매출 규모, 소속 봉직의 및 간호인력 수, 비급여 과세 비율, MSO 법인 운영 여부에 따른 합리적 산정 기준을 따르며, 법인사업자 대상 가격 표시는 세무사법 규정에 따라 1:1 맞춤 협의로 진행됩니다. 영세한 범위를 초과하는 병원급 의료기관, 네트워크 지점 운영, MSO 법인 설립 및 영업권 평가 등 특수 복합 케이스는 별도 협의 필요로 분류되어 면밀한 사전 실사 후 최적의 수수료가 결정됩니다.
병의원 연간 세무 로드맵

원장님이 놓쳐서는 안 될 12개월 세무 컴플라이언스 캘린더

비급여 부가세 신고, 사업장현황신고, 성실신고확인까지 연중 모든 세무 일정을 정평세무컨설팅이 선제적으로 완벽 관리합니다.

01월 부가가치세

2기 부가가치세 확정신고

7~12월 비급여 과세 진료 수입금액 확정 신고 및 공통매입세액 정산. 의료기기 리스료 매입세액공제 점검.

02월 사업장현황

사업장현황신고 & 연말정산

건보 요양급여 수입금액 및 의약품·의료기기 수불부 국세청 제출. 봉직의(페이닥터) 및 간호인력 연말정산 확정.

03월 법인세

MSO 법인 법인세 신고

병원경영지원 MSO 법인 결산. 장비 렌탈 및 경영자문 용역비 손금 정합성 검증, 의료기기 투자세액공제 신청.

05월 핵심 종소세

종합소득세 확정신고 & 결산

개인 의원 종합소득세 신고. 조특법 제24조 기기공제 및 네트급여 경비 반영. 스탠다드 플랜 세무조정료 0원.

06월 성실신고

성실신고확인 종합소득세 신고

연매출 5억 원 초과 성실신고대상 병의원 신고. 전자차트, 비급여 결제 내역, 의약품 수불부 전수 사전 소명.

07월 부가가치세

1기 부가가치세 확정신고

1~6월 상반기 비급여 과세 매출 집계 및 의료 소모품 매입세액공제 점검. 상반기 병의원 수입금액 마감.

의료기기사·제약사·의사회 공식 제휴

정평세무컨설팅 B2B 공식 업무제휴 제안

의료기기 제조/리스사, 제약사, EMR 전자차트 솔루션사, 지역 의사회 및 치과의사회와의 전략적 회원 병의원 단체 기장 및 세무 자문 제휴를 접수받습니다.

* 접수된 제휴 제안서는 이민우 대표 회계사가 직접 검토 후 24시간 이내에 회신드립니다.

빠른 간이 세무 상담

원장님을 위한 1:1 비대면 병의원 세무 진단 신청

비급여 과·면세 안분 환급, 봉직의 네트제 Gross-up 정비, 의료기기 투자세액공제, MSO 설립 등 궁금하신 점을 남겨주시면 담당 회계사가 데이터 검토 후 신속히 연락드립니다.

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원장님이 가장 자주 묻는 핵심 세무·노무·MSO 실무 가이드 24선

비급여 과·면세 안분, 페이닥터 네트제, 의료기기 투자세액공제, MSO 설립까지 병의원 실무에 즉시 적용되는 명쾌한 답변을 확인하세요.

부가가치세법 시행령 제35조에 따라 국민건강보험 요양급여 대상 진료는 면세입니다. 반면 미용·성형 목적의 비급여 진료(쌍꺼풀, 코성형, 유방확대/축소, 지방흡입, 주름살제거, 안면윤곽, 치아교정/미백, 라식/라섹, 점/기미/주근깨 치료 등)는 부가가치세 10% 과세 대상입니다. 치료 목적의 질환 치료(여드름 흉터 염증 치료, 화상 흉터, 안검하수 등)는 비급여라 하더라도 면세에 해당하므로 진료기록부상 치료 목적 입증이 핵심입니다.
병원 인테리어 공사비, 건물 임차료, 엑스레이/멸균기 등 과세와 면세 진료에 공통으로 사용되는 재화·용역의 매입세액은 당해 과세기간의 [과세공급가액 / (과세공급가액 + 면세수입금액)] 비율로 안분 계산하여 과세 비율에 해당하는 금액만 부가가치세 매입세액으로 환급받습니다. 정평세무컨설팅은 전용 장비와 공통 장비를 정밀 분류하여 매입세액공제액을 합법적으로 극대화합니다.
네트제 계약 시 병원이 대신 납부해 주는 봉직의의 근로소득세, 지방소득세, 건강보험료, 국민연금 등은 세법상 '근로의 대가'에 해당하므로, 이를 합산한 세전 총급여(Gross-up)로 역산하여 원천징수이행상황신고서와 근로소득 지급명세서를 제출해야 합니다. 그래야만 대납한 세금 전액을 병원의 합법적인 인건비(손금/필요경비)로 인정받아 소득세를 절감할 수 있습니다.
대법원 판례에 따라 단순히 '월 실수령액에 퇴직금이 포함되어 있다'는 조항은 퇴직금 분할 약정 무효 판결을 받아 퇴직 시 퇴직금을 전액 별도로 지급해야 하는 위험이 있습니다. 표준 근로계약서상 실수령 보장 구조, 연말정산 환급금의 병원 귀속 조항, 법정 퇴직금 산정을 위한 세전 총급여 산출 근거를 법리적으로 정밀하게 명문화해야만 소급 퇴직금 청구를 완벽히 차단할 수 있습니다.
조세특례제한법 제24조(통합투자세액공제)는 사업용 기계장치를 매입하거나 '금융리스'로 취득하여 고정자산으로 등재하는 경우에 적용됩니다. 리스 계약이 금융리스 요건을 갖춘 경우 장비 도입 금액의 10%를 종합소득세 또는 법인세에서 직접 차감받을 수 있습니다. 반면 운용리스는 리스료 전액을 손금(경비) 처리하는 방식이므로 장비별 현금 흐름에 따라 최적의 방식을 사전 시뮬레이션해야 합니다.
중소기업 기준 의료기기 설비 투자금액의 10%가 기본 세액공제되며, 직전 3개년 평균 투자액을 초과하는 신규 투자분에 대해서는 추가 3%가 더해져 최대 13%까지 세액공제를 받습니다. 개업 초기 설비 투자로 결손이 발생하거나 최저한세 적용으로 당해연도에 다 공제받지 못한 금액은 향후 10년간 이월되어 다음 연도 이후 발생하는 소득세에서 차감됩니다.
소득세법상 보건업(병의원, 치과의원, 한의원)은 당해연도 수입금액(비급여 + 요양급여 합산)이 5억 원 이상인 경우 성실신고확인대상자로 지정됩니다. 6월 30일까지 세무대리인의 확인서를 첨부하여 신고해야 하며, 미제출 시 산출세액의 5% 가산세와 세무조사 대상 선정이 뒤따릅니다. 철저한 사전 결산 감수와 적격증빙 구비로 무결점 소명을 달성해야 합니다.
1) 동일 진료과목·동일 상권 대비 원장 1인당 소득률이 현저히 낮은 경우, 2) 의약품·의료소모품 사입액 대비 비급여 매출 비율이 비정상적으로 저조한 경우, 3) 현금영수증 및 신용카드 매출 비율이 급격히 변동한 경우, 4) 원장 및 가족의 재산 증가액과 카드 소비액이 신고 소득을 크게 초과하는 PCI(재산·소비·소득) 불일치가 포착될 때 우선 조사 대상으로 선정됩니다.
개인 병의원의 진료 수익 중 경영지원, 마케팅, 전산 개발, 의료기기 렌탈, 의약품 유통 등 비의료 경영 용역을 MSO 법인에 외주 위탁하고 용역비를 지급하는 구조입니다. 이를 통해 개인 병의원의 49.5% 최고세율 구간 소득을 9~19%의 저율 법인세율이 적용되는 MSO 법인으로 합법 분산하여 매년 수천만~수억 원의 누진세를 합법적으로 절감할 수 있습니다.
국세청은 MSO가 실제 사무실, 상근 인력, 전산 시스템 없이 서류상으로만 존재하는 페이퍼컴퍼니인 경우 용역비 전액을 손금 부인합니다. 이를 방어하려면 1) 독립된 사무실과 사업자등록, 2) 전담 직원 채용 및 4대보험 가입, 3) 구체적인 경영자문 보고서 및 마케팅 성과물, 4) 시가에 부합하는 적정 용역 단가 계약서가 반드시 완비되어야 합니다.
개인 병의원이 축적한 인지도, 진료 노하우, 환자 데이터베이스의 가치를 감정평가법인을 통해 '영업권'으로 정밀 평가하여 MSO 법인에 유상 양도할 수 있습니다. 원장님은 양도대금을 기타소득(60% 법정 필요경비 공제, 실효세율 8.8%)으로 저율 과세받고, MSO 법인은 5년간 매년 20%씩 감가상각비(손금)로 털어내어 막대한 법인세를 절감합니다.
병원 업무와 무관한 배우자/자녀 전용 차량, 가족 거주 아파트 관리비, 사적 마트 쇼핑 영수증을 병원 필요경비로 계상하는 행위는 국세청 기획조사에서 100% 적발되는 대표적인 가사 관련 경비입니다. 적발 시 필요경비 전액 부인은 물론 부정과소신고가산세(40%) 및 납부지연가산세가 중과되므로 철저히 업무전용차량 등록 및 운행기록부를 구비해야 합니다.
의료법상 금지된 불법 리베이트는 국세청 세무조사에서 포탈 소득으로 산입되어 종합소득세 및 가산세가 추징될 뿐만 아니라 보건복지부 면허정지 및 형사고발로 이어집니다. 반면 약사법상 허용되는 법정 금융할인(결제 기한에 따른 적법 할인)이나 정당한 임상시험 자문료는 공식 세금계산서와 계약서를 갖추어 정당하게 세무 처리해야 안전합니다.
병의원은 현금영수증 의무발행업종으로 건당 거래금액(부가세 포함)이 10만 원 이상인 경우 환자가 현금영수증 발행을 원하지 않거나 인적사항을 밝히지 않더라도 결제일로부터 5일 이내에 국세청 지정 코드(010-000-1234)로 자진 발급해야 합니다. 미발급 시 거래대금의 20%에 달하는 가산세가 부과되므로 전자차트와 포스기 자진발급 자동화 연동이 필수적입니다.
조세특례제한법상 통합고용세액공제에 따라 만 15~34세 청년 정규직 간호인력을 신규 채용할 경우, 수도권 외 지역은 1인당 최대 1,550만 원, 수도권은 1인당 최대 1,450만 원을 3년간(총 4,350~4,650만 원) 소득세나 법인세에서 직접 차감받을 수 있습니다. 상시근로자 수 유지 요건을 충족하면 막대한 세금을 합법 감면받습니다.
국세청은 병의원 세무조사 시 EMR(전자의무기록) 프로그램의 로그 기록과 데이터베이스 수정 이력을 디지털 포렌식으로 추출합니다. 현금 수납 후 차트 삭제, 진료비 할인 후 수기 감액 기록은 즉시 매출 은닉 혐의로 간주됩니다. 정평세무컨설팅은 결제 로그와 차트 기록의 완벽한 1:1 정합 프로세스를 구축하여 디지털 감사 위험을 사전 차단합니다.
보톡스, 필러, 임플란트 픽스처, 백내장 인공수정체 등 주요 비급여 재료의 매입 수량 대비 신고된 시술 건수가 부족하면 국세청은 '현금 매출 누락' 혐의를 둡니다. 시술 중 불량 파손, 환자 거부 폐기, 리터치 무상 A/S 보증 등에 대한 [의약품·소모품 폐기 및 재시술 대장]을 구비하여 입고-사용-폐기의 인과관계를 객관적으로 소명해야 합니다.
소득세법 제43조에 따라 공동사업장의 순이익을 약정된 손익분배 비율(예: 5:5, 6:4)대로 분배하여 각 원장님이 개별 소득세를 신고합니다. 단독 개원 시 45% 최고 누진세율이 적용될 소득을 2인 이상으로 분산함으로써 매년 수천만 원에서 억대 소득세를 합법적으로 절감할 수 있습니다. 단, 실제 공동 출자와 경영 참여가 입증되어야 합니다.
공동사업에서 탈퇴하거나 병원을 포괄양수도할 때 수수하는 영업권(권리금)은 양도자에게는 기타소득(60% 필요경비 인정, 실효세율 8.8%) 또는 양도소득세 과세 대상이 되며, 양수자는 5년간 감가상각비로 비용 처리할 수 있습니다. 지분 정산 방식과 의료기기 잔존가액 평가를 사전에 세무적으로 정합시켜야 탈퇴 시 세금 분쟁을 막을 수 있습니다.
네, 사실입니다. 일반 세무사 사무실은 평소 기장료를 낮게 받다가 5월 종소세 신고와 6월 성실신고확인철에 병의원 매출 규모를 핑계로 수백~수천만 원의 세무조정료를 기습 청구합니다. 정평세무컨설팅의 스탠다드 플랜은 매월 기장료에 연간 세무조정료를 균등 안분하여 기본 포함시켰으므로, 5월 종합소득세 신고 시 별도의 추가 조정료가 전혀 청구되지 않습니다.
병원 인테리어 칸막이, 무균 수술실 배관 공조 설비, 바닥재, 조명 설비는 구축물 및 시설장치로 분류됩니다. 세법상 기준 내용연수 5년(선택 범위 4~6년) 중 최단 내용연수인 4년을 선택하여 개업 초기 1~3년 차에 감가상각비를 집중 반영함으로써 개원 초기의 높은 소득세 부담을 획기적으로 낮출 수 있습니다.
가족이 실제로 병원에 상근하며 예약 관리, 인사 노무, 구매 정산, 행정 업무 등 실질적인 노무를 제공한 객관적 사실을 입증해야 합니다. 근로계약서, 출퇴근 지문/기록부, 업무 일지, 급여 전용 계좌 이체 내역 및 4대보험 취득 신고가 완비되어 있다면 국세청 세무조사 시 전액 정당한 필요경비로 인정받습니다.
1) 현금 결제 유도 후 비급여 수입금액 차명계좌 은닉, 2) 의약품/보톡스/필러 사입량 대비 시술 수입금액 과소신고, 3) 페이닥터 네트급여 Gross-up 누락에 따른 원천세 탈루, 4) 실질 없는 MSO 법인을 통한 가공 경영컨설팅 수수료 송금, 5) 원장 가족의 사적 가사 경비(고가 외제차, 백화점 쇼핑) 편법 계상이 5대 집중 조사 대상입니다.
홈택스에서 수임동의 클릭 한 번으로 1분 만에 변경이 완료됩니다. 기존 세무사에게 원장님께서 직접 연락하실 필요 없이, 정평세무컨설팅이 기존 전산 장부 데이터를 직접 인계받아 과거 5년간 누락된 의료기기 투자세액공제와 비급여 공통매입세액을 전액 환급받도록 경정청구를 원스톱으로 대행해 드립니다.
정평세무컨설팅 이민우 공인회계사
EY 한영 회계법인 감사본부 출신
대표 세무전문가

"병의원 세무는 단순 기장이 아닌, 과·면세 정밀 안분과 페이닥터 노무의 엄격한 데이터 감사입니다"

병의원은 국민건강보험 요양급여와 비급여 과세 매출, 봉직의 네트제 급여, 고가 의료장비 감가상각과 성실신고가 얽혀 있는 최고난도의 전문 회계 영역입니다. 글로벌 대형 회계법인 감사본부 출신의 엄격한 회계 감사 노하우와 스마트 세무 자동화 플랫폼 기장팩토리 기술을 결합하여, 원장님의 소중한 병의원을 가산세와 세무 리스크로부터 완벽히 보호해 드리겠습니다.

대한민국 공인회계사 (KICPA) / 세무사 자격 보유
글로벌 빅4 EY 한영회계법인 감사본부 출신
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