2026 의료세법 완벽 반영 | 병의원·치과·한의원·약국 전문 세무센터

사업장현황신고 가산세 제로,
봉직의 Net급여 & 성실신고 완전 방어

2월 10일 면세사업자 사업장현황신고 수입금액 검토표, 페이닥터 Net(네트제) 급여 원천세 대납분 Gross 환산, 비급여 피부·성형 및 약국 과면세 안분계산, 연수입 5억 초과 성실신고확인 사전 대비까지 — 대형 회계법인(EY한영) 출신 코딩하는 회계사 이민우기장팩토리가 원장님의 안전한 진료 환경을 세무적으로 지켜냅니다.

2월 사업장현황신고
수입금액 불성실가산세 0%
봉직의 Net급여 정규화
퇴직금 판례 대응 특약
성실신고확인 3단계
수입 5억 초과 사전 실사
medical_tax_reconciler.py
MED-TECH v2.6

# 정평세무컨설팅 병의원 수입금액 전산 대사 엔진

class MedicalTaxAuditor:

def __init__(self, clinic_id):

self.hira_sales = fetch_hira_stream(clinic_id) # 심평원 요양급여

self.non_covered = fetch_emr_cash(clinic_id) # 비급여 수납

def audit_reporting_duty(self):

# 1. 2월 10일 사업장현황신고 수입금액 100% 매칭

verified_rev = self.reconcile_all_channels()

# 2. 페이닥터 Net 실수령액 -> 세전 Gross 환산

gross_salary = self.calc_net_to_gross(shield_tax=True)

# 3. 과세/면세 공통매입세액 면세공급가액 안분

vat_proration = self.prorate_common_input_vat()

return "가산세 0% & 성실신고 사전 방어 완비"

EY한영 출신 공인회계사 직접 감수 HIRA Match: 100.0%
맞춤형 타깃 페르소나

진료 과목 및 의료 형태별 맞춤 세무 솔루션

급여 중심 로컬 의원부터 비급여 피부·성형외과, 치과, 한의원, 대형 문전약국까지 업태별 특성에 최적화된 전문 세무팀이 전담 배정됩니다.

PERSONA 01

급여 로컬 의원 (내과·이비인후과)

건강보험공단 요양급여 청구액과 자동차보험, 본인부담금의 정합성 관리와 간호사 채용에 따른 통합고용세액공제 극대화가 필요한 의원.

심평원 요양급여 100% 정합
간호인력 고용세액공제(1,550만)
PERSONA 02

피부과·성형외과 (비급여 과세)

쌍꺼풀, 보톡스, 필러, 색소레이저 등 미용시술 10% 부가가치세 과세와 면세 공통매입세액 안분계산 및 고가 의료장비 리스 세무가 핵심인 병원.

미용시술 부가세 안분계산
레이저 장비 리스 감가상각
PERSONA 03

치과의원 & 한의원·한방병원

치과기공소 계산서 매입 건수와 임플란트 픽스처 재고 매칭, 한약재 면세 매입과 첩약 급여화에 따른 원가율 관리 및 성실신고 대비가 시급한 원장님.

기공물·임플란트 매입 매칭
한약재·첩약 원가율 관리
PERSONA 04

대형 문전약국 & 로컬 약국

처방조제(부가가치세 면세)와 일반의약품·건기식(과세 10%)의 공통매입세액 안분계산, 제약사·도매상 매입 세금계산서 정합성이 중요한 약국.

조제 면세 vs 매약 과세 안분
제약사 세금계산서 전산 정합
병의원 5대 세무 함정

진료에만 전념하다가
수천만 원대 가산세와 세무조사를 맞는 5대 원인

국세청 전산망과 심평원이 실시간으로 연동되는 의료업계. 일반 업종과 동일하게 처리하는 세무사무실에 맡겼다가는 돌이킬 수 없는 추징을 맞게 됩니다.

PAIN 01. 2월 사업장현황신고 가산세

수입금액 불일치로 0.5% 가산세 및 세무조사 대상

2월 10일 면세사업자 사업장현황신고서의 수입금액이 심평원 요양급여 포털 및 신용카드·현금영수증 발행액과 어긋나거나 5월 종합소득세 신고서와 불일치하면 수입금액의 0.5% 가산세가 부과되고 탈루 혐의 병의원으로 즉각 전산 분류됩니다.

JP SOLUTION: 수입금액 검토표 100% 매칭

심평원 요양급여 + 비급여 수납액 전산 크로스체크

정평세무컨설팅은 EMR 전자차트 수납 원장과 심평원 요양급여·자동차보험 청구액을 전산 대사하여 수입금액 검토표를 완벽하게 작성합니다. 오차 0원의 정합성을 확보하여 국세청 사후검증을 원천 차단합니다.

PAIN 02. 봉직의 Net계약 퇴직금 역풍

원천세 대납분 누락 및 대법원 판례 패소

원장님이 봉직의 세금과 4대보험을 대납해 주는 관행적 Net계약을 체결했으나, 대납액을 세전 총급여(Gross)로 환산 신고하지 않아 원천징수불성실가산세(최고 10%)가 부과되고, 퇴직 시 세전 총급여 기준 퇴직금 청구 소송(대법원 2020다226447)을 당합니다.

JP SOLUTION: Gross 환산 표준 계약 체계

세전 총급여 역산 명시 & 연말정산 환급금 귀속 특약

봉직의 실수령액에 상응하는 Gross 총급여액을 산출하여 원천세를 적법 신고하고, 계약서에 연말정산 환급금 병원 귀속 및 퇴직금 산정 기준을 법률상 유효하게 명문화하여 퇴직금 분쟁을 100% 방어합니다.

PAIN 03. 과·면세 공통매입세액 안분 실패

피부·성형 비급여 및 약국 매약 매입세액 추징

피부 미용시술이나 약국 일반약 등 부가세 과세 매출과 질병 치료·처방조제 면세 매출이 공존할 때, 임차료·인테리어비 등 공통매입세액을 잘못 안분하여 과다 환급받았다가 국세청 사후검증에서 수천만 원 추징을 당합니다.

JP SOLUTION: 과면세 안분계산 정밀 프로토콜

공급가액 비율에 따른 법정 안분 & 정산 세무조정

과세 공급가액과 면세 수입금액의 비율을 일자별로 정밀 안분하여 공통매입세액 공제액을 산출하고, 반기별 정산 세무조정을 통해 과소신고 가산세나 불공제 리스크를 완벽하게 통제합니다.

PAIN 04. 현금영수증 의무발행 위반

건당 10만원 미발행 과태료 폭탄 (미발행액의 20%)

비급여 진료비 수납 시 환자가 요청하지 않거나 인적사항을 밝히지 않았다는 이유로 현금영수증을 발급하지 않았다가, 환자의 포상금 신고나 제보로 미발행 금액의 20%에 달하는 무거운 가산세가 부과됩니다.

JP SOLUTION: 5일 이내 국세청 자진발급

지정 코드(010-000-1234) 자진발급 전산 프로세스

환자의 인적사항을 모를 때에도 현금 수령일로부터 5일 이내 국세청 지정 번호로 자진발급하도록 매뉴얼화하고, 병원 EMR 수납 데이터와 현금영수증 승인 내역을 대조하여 미발행 리스크를 원천 제거합니다.

PAIN 05. 수입 5억 성실신고 대란

마감 직전 기습 조정료 청구 및 적격증빙 부실

수입금액이 5억원을 초과하여 성실신고확인대상자가 되었으나, 세무사 사무실에서 5월 마감 직전에야 통보하여 수백만원의 수수료를 일시 청구하고 적격증빙(3만원 초과) 누락으로 소득세 최고세율을 두들겨 맞습니다.

JP SOLUTION: 사전 3단계 가결산 & MSO 자문

10월·11월 가결산 & 의료법 준수 MSO 법인 소득 분산

정평은 연말 전 10월과 11월에 사전 가결산을 실시하여 사업용 계좌와 적격증빙을 100% 매칭합니다. 아울러 의료법 제33조를 준수하는 합법적 MSO(경영지원회사) 설립을 통해 합법적으로 소득세율을 분산합니다.

MEDICAL TAX COMPETENCY MATRIX

정평세무컨설팅 의료약학본부 vs 일반 세무사 사무실 10대 역량 비교

왜 전국 수백 곳의 원장님과 약사님들이 정평과 기장팩토리를 선택하는지 확인하세요.

세무 관리 영역 정평세무컨설팅 × 기장팩토리 일반 세무사 사무실
1. 사업장현황신고 대사 심평원 요양급여·비급여 수입금액 검토표 100% 전산 대사 원장님이 보내준 대략의 숫자로 단순 입력 후 가산세 위험 방치
2. 봉직의 Net급여 정규화 대납 세금 Gross 총급여 환산 및 대법원 퇴직금 판례 대응 특약 실수령액만 기재하여 원천세 가산세(10%) 및 퇴직금 소송 패소
3. 피부·성형 과면세 안분 미용시술 10% 과세 및 임차료·인테리어 공통매입세액 정밀 안분 안분 비율 오류로 매입세액 과다공제 추징 및 가산세 발생
4. 약국 조제·매약 안분 조제(면세) vs 일반약(과세) 분리 및 제약사 세금계산서 크로스체크 약국 매출 구조를 이해하지 못해 부가세 신고서 오류 빈발
5. 고가 의료장비 리스 금융리스 vs 운용리스 비교 및 조특법 제24조 투자세액공제(최대 10%) 단순 리스료 영수증 처리로 세액공제 수천만원 누락
6. 성실신고 사전 대비 연 3회(10·11·12월) 사전 가결산 및 3만원 초과 적격증빙 100% 매칭 5월에 갑자기 성실신고 대상이라며 수백만원 조정료 일시 청구
7. 의료 인력 세액공제 간호사·치위생사 채용 시 통합고용세액공제(청년 1인 연 최대 1,550만) 퇴사자 사후관리 귀찮아서 아예 세액공제 신청을 누락함
8. 현금영수증 의무발행 10만원 이상 5일 이내 국세청 코드(010-000-1234) 자진발급 전산화 환자 미요청 시 미발급 방치하다 과태료(20%) 폭탄
9. MSO 법인 자문 의료법 제33조 준수 합법적 MSO 지배구조 설계 및 법인세율 분산 사무장병원 리스크를 몰라 위장 MSO 설립 후 세무조사 피탈
10. 총괄 책임자 전문성 대형 회계법인(EY한영) 출신 이민우 공인회계사 직접 감수 세무사는 얼굴도 보기 힘들고 무자격 사무장이 처리
소득세법 제78조 & 의료법

2월 사업장현황신고 수입금액 검토표 &
봉직의 Net(네트제) 급여 완벽 가이드

국세청 전산망이 의료기관을 평가하는 가장 중요한 2대 지표. 수입금액 불일치 가산세와 봉직의 퇴직금 소송 리스크를 사전 차단합니다.

MEDICAL REVENUE VERIFICATION MATRIX

병의원 수입금액 4대 채널 및 국세청 전산 대조 기준

소득세법 시행령 제141조
수입금액 항목 자료 출처 및 증빙 국세청 전산 대조 방식 불일치 시 세무상 불이익
1. 건강보험 요양급여 국민건강보험공단 지급통보서 (공단부담금 + 본인부담금) 건보공단 전산망 자동 100% 매칭 과소신고 시 즉각 소명 통보 및 0.5% 가산세
2. 의료급여 & 보훈진료 시·군·구청 및 국가보훈처 진료비 정산 내역 지자체 지출 자료와 일괄 대조 누락 시 사업장현황신고 불성실 가산세
3. 자동차보험 & 산재보험 손해보험사 지급명세서 및 근로복지공단 통보서 보험사 원천징수 자료 상호 대조 세무조사 수입금액 적출 1순위 항목
4. 순수 비급여 진료비 신용카드, 현금영수증, 순수 현금 수납액 여신금융협회 + 의약품/기공물 매입 비율 대사 의약품 대비 비급여 과소 시 기획 세무조사
PAY-DOCTOR NET SALARY STRUCTURING

봉직의(페이닥터) Net계약 대법원 판례(2020다226447)와 퇴직금 방어 3대 수칙

원장님이 대신 낸 세금이 퇴직금 산정 기준(평균임금)에 합산된다는 판례에 따른 필수 계약 정비 지침입니다.

01
수칙 1

세전 총급여(Gross) 계약서 병기

근로계약서에 '실수령액 월 1,500만원'만 적지 말고, 대납 소득세와 4대보험을 합산한 '세전 총급여 월 2,210만원'을 명시하여 원천징수불성실가산세(최고 10%)를 원천 차단합니다.

Gross 환산액 의무 기재
02
수칙 2

연말정산 환급금 귀속 특약

병원장이 세금을 전액 대납했으므로 2월 연말정산 시 발생하는 세금 환급금은 당연히 병원(사용자)에 귀속된다는 특약을 계약서에 명문화하여 반환 분쟁을 사전 예방합니다.

환급금 병원 귀속 유효성 확립
03
수칙 3

퇴직금 사전 적립 및 DB형 확정

퇴직금 분할 약정은 무효이므로, 세전 Gross 급여 기준으로 퇴직연금(DC/DB)을 매월 적립하여 퇴직 시점에 수억 원대 퇴직금 폭탄이 발생하는 유동성 위기를 방지합니다.

퇴직연금 사전 적립 의무화
NON-COVERED MEDICAL VAT TAXABILITY MATRIX

병의원 5대 진료과목별 비급여 진료 부가가치세 과세(10%) vs 면세 판정 기준표

부가가치세법 시행령 제35조에 따른 미용·성형 목적 과세 항목과 질병 치료 목적 면세 항목의 세법상 분류 기준입니다.

진료 과목 부가가치세 과세 대상 (10%) 부가가치세 면세 대상 (0%) 세무 관리 핵심 포인트
피부과 (Dermatology) 보톡스, 필러, 레이저 토닝, 점·주근깨·기미 색소치료, 여드름 흉터치료, 제모, 모공축소 아토피, 건선, 대상포진, 접촉성 피부염, 화상, 티눈·사마귀 등 질병 치료 진료차트상 치료 목적 진단명 명시 및 과세/면세 수납 전산 분리
성형외과 (Plastic Surgery) 쌍꺼풀(중검술), 코성형(융비술), 유방확대·축소술, 지방흡입, 주름살제거, 턱윤곽술 구순구개열, 안검하수(시야장애 교정), 유방암 수술 후 재건술, 안면골절 정복술 안검하수 시야장애 안과 소견서 및 보험청구 자료 보관 의무
안과 (Ophthalmology) 라식, 라섹, 스마일라식 등 굴절교정술, 미용 써클렌즈 처방, 눈꺼풀 미용성형 백내장, 녹내장, 망막박리, 다초점 인공수정체 삽입술(백내장 치료 목적), 사시 수술 백내장 다초점렌즈 비급여 수납 시 실손보험 청구서류와 부가세 일치
치과의원 (Dentistry) 치아미백술, 라미네이트(치아성형), 잇몸 미용 미백치료 임플란트, 틀니, 치아교정(저작기능장애), 충치치료, 보철(크라운·인레이), 치주치료 기공소 계산서 매입 건수와 임플란트 픽스처 수량 대비 매출 매칭
한의원·한방병원 비만 다이어트 한약, 한방 미용 침, 매선요법, 비만 약침치료 질병 치료용 첩약, 침구·부항·뜸 치료, 추나요법, 건강보험 적용 첩약 한약재 원재료 면세 계산서 매입과 비만약 매출 정합성 유지
의료 자산 & 일정 관리

고가 의료장비 리스 세액공제 &
12개월 병의원·약국 필수 세무 캘린더

수억 원대 레이저·CT 리스 처리 방식에 따른 투자세액공제와 단 하루도 놓쳐선 안 되는 의료 세무 일정을 안내합니다.

MEDICAL LEASE & TAX CREDIT COMPARISON

의료장비 금융리스 vs 운용리스 세법상 취급 및 세액공제 비교

조세특례제한법 제24조
비교 항목 금융리스 (자산 취득 의제) 운용리스 (단순 임차) 정평세무컨설팅 맞춤 권고
세법상 소유권 병원이 직접 취득한 고정자산으로 계상 리스회사의 자산 (임대차 관계) 개원 초기 재무상태표 구조에 맞춰 설계
비용 처리 방식 감가상각비(5년) + 리스 이자비용 매월 납부하는 리스료 전액 임차료 처리 초기 비용화 속도와 절세 효과 극대화
통합투자세액공제 (조특법 제24조) 투자금액의 1% ~ 최대 10% 직접 공제 가능 적용 불가 (임차 자산) 수억원대 CT/MRI 도입 시 금융리스 적극 권장
중도 해지 및 만기 인수 만기 시 잔존가치로 소유권 완전 이전 반납, 재리스, 인수 중 선택 의료기기 기술 수명에 따른 전략적 판단
PHARMACY VAT PRORATION RULES

약국의 조제(면세) vs 일반의약품(과세) 공통매입세액 안분계산

약국 임차료, 인테리어비, POS 수수료 등 공통 지출에 대한 부가가치세 불공제 세액 안분 공식입니다.

불공제 매입세액 = 공통매입세액 × ( 면세 조제 수입금액 ÷ 총 공급가액(조제+매약) )

처방 조제 비중이 높은 문전약국일수록 불공제 매입세액이 커지므로, 매약 전용 설비와 공통 설비를 최초 계약 단계부터 정밀 분리하여 불필요한 부가가치세 불공제를 방지해야 합니다.

연간 의료 세무 캘린더

병의원·약국 원장님을 위한 12개월 필수 세무 일정표

2월 사업장현황신고부터 6월 성실신고확인까지 의료 세무의 핵심 일정을 기장팩토리가 전산 스케줄링으로 챙깁니다.

1분기 (Q1)
1월 25일: 피부·성형 비급여 및 약국 매약 2기 부가세 확정신고
2월 10일: 면세사업자 사업장현황신고 (수입금액검토표 필수 제출)
2월 말일: 봉직의·간호사 연말정산 및 간이지급명세서 제출
3월 31일: 의료법인 및 MSO 법인세 확정신고
2분기 (Q2)
4월 25일: 과세사업 부가세 1기 예정신고/고지
5월 31일: 종합소득세 확정신고 (수입 5억 미만 일반 병의원)
6월 30일: 성실신고확인대상자 (수입 5억 초과) 종합소득세 마감
3분기 (Q3)
7월 25일: 비급여 과세 및 약국 1기 부가세 확정신고 (안분 정산)
8월 31일: 법인 의료기관 중간예납 납부
9월 30일: 고가 의료장비 리스 계약 및 세액공제 중간 실사
4분기 (Q4)
10월 25일: 부가세 2기 예정신고 / 1차 병원 사전 가결산
11월 30일: 2차 가결산 (수입 5억 돌파 여부 및 적격증빙 100% 매칭)
12월 31일: 의약품·소모품 기말 재고 실사 및 인건비 마감
MEDICAL STAFF EMPLOYMENT & TAX MATRIX

병의원 의료 인력 고용 형태별 세법상 의무 및 4대보험 노무 대조표

봉직의부터 정규직 간호사, 파트타임 알바까지 계약 형태별 원천징수와 노동법상 유의사항입니다.

직무 및 고용형태 세법상 소득 구분 원천징수 방식 4대보험 가입 의무 퇴직금 및 핵심 쟁점
봉직의 (Net계약 페이닥터) 근로소득 (원천징수 대상) 세전 Gross 환산 간이세액표 4대보험 전액 의무 가입 대법원 판례상 세전 총급여 기준 퇴직금 지급
정규직 간호사·치위생사 근로소득 간이세액표 (비과세 식대 20만) 4대보험 전액 가입 조특법 제29조의8 고용세액공제(최대 4,650만)
초단시간 간호조무사 (주 15시간 미만) 단시간 근로소득 간이세액표 / 간이지급 제출 산재보험만 가입 (건강·연금·고용 면제) 주휴수당 및 퇴직금 법적 면제
원무과 일용근로자 (단기 알바) 일용근로소득 일 15만 비과세 초과분 2.7% 고용·산재 가입 (월 8일 미만 시 건보·국민 면제) 일용근로 지급명세서 매월 말일 홈택스 제출
의료법 제33조 준수 & 데이터 엔지니어링

합법적 병원 MSO 법인 설립 &
EMR·심평원 전산 데이터 파이프라인

개인소득세 최고세율 49.5% 구간에 진입한 병의원을 위한 적법한 법인 지배구조 설계와 전산 자동화 기장 시스템을 제공합니다.

LEGAL MSO STRUCTURING

사무장병원 리스크 없는 적법 병원 MSO(경영지원회사) 설계

의료법 제33조에 따라 비의료인의 의료기관 개설은 엄격히 금지됩니다. 그러나 MSO 법인이 의약품 및 소모품 구매대행, 원무 행정 컨설팅, 시설 및 의료기기 임대, 홍보 마케팅 등 비의료 경영 지원 용역을 실질적으로 수행하고 시가에 부합하는 정당한 대가를 수취하는 구조는 100% 적법하며, 개인소득세를 9~19% 법인세율로 합법 분산할 수 있습니다.

STRATEGY 01

실질 경영지원 용역 계약

원무 행정, 시설 관리, 소프트웨어 제공 등 실제 용역을 수행하고 용역보고서 및 세금계산서를 철저히 구비하여 가장거래 의혹을 원천 배제합니다.

STRATEGY 02

가족 지분 분산 & 배당 플랜

MSO 법인의 주주로 배우자 및 자녀를 적법하게 구성하여, 연간 2,000만 원 한도 내에서 15.4% 분리과세 배당을 실행해 가계 소득을 분산합니다.

STRATEGY 03

의료법인 전환 연계 검토

병상 수가 많고 종합병원급 규모로 성장할 경우 비영리 의료법인 설립 및 가업승계 지원 플랜을 빅4 감사본부 출신 회계사가 정밀 감수합니다.

TAX ROADMAP BY REVENUE TIER

병의원 연간 수입금액별 세법상 의무 & 세무 관리 로드맵

수입금액이 상승함에 따라 국세청 전산 검증과 세무조사 감시 수위가 단계별로 강화됩니다.

수입금액 구간 세법상 기장의무 성실신고확인 여부 핵심 세무 쟁점 및 솔루션
1억 5천만원 미만 간편장부 또는 복식부기 해당 없음 초기 개원 인테리어비 및 의료기기 조기환급, 사업용 계좌 신고
1억 5천만 ~ 5억원 복식부기의무자 해당 없음 (일반 소득세 신고) 2월 사업장현황신고 수입금액 대조, 페이닥터 Net급여 원천세 정규화
5억 ~ 7억 5천만원 복식부기 + 성실신고확인 성실신고확인대상 (6월 30일 마감) 3단계 사전 가결산, 필요경비 적격증빙 100% 매칭, 통합고용세액공제
7억 5천만 ~ 10억원 복식부기 + 성실신고확인 집중 관리 대상 최고세율 42% 진입 방어, 간호인력 고용증대 세액공제 사후관리
10억원 초과 복식부기 + 성실신고확인 국세청 전산 특별 관리 의료법 준수 MSO 법인 설립 및 지분 분산, 공동개원 지분 최적화
LEGAL MSO VS ILLEGAL CLINIC CRITERIA

보건복지부 행정해석 및 대법원 판례 기준 합법 MSO vs 위장 사무장병원 6대 판정 기준표

의료법 제33조 제2항 위반 리스크를 원천 배제하기 위한 정평세무컨설팅의 법률·세무 검증 기준입니다.

검증 항목 합법적 MSO (경영지원법인) 불법 사무장병원 위장 MSO 대법원 판례 및 대응 방안
1. 진료권 및 의료 행위 원장님이 진료, 처방, 환자 수납 전권 100% 독점 행사 MSO가 진료 실적 강요, 비급여 시술 지시 등 개입 대법원 2017도18322: 의료 행위 독자성 보장 필수
2. 용역 대가 산정 방식 제공된 비의료 경영 용역에 대한 시가 부합 정액 수수료 병원 진료 매출의 일정 %를 이익 분배 명목으로 수취 원가 산정 근거표 및 정액제 용역계약서 작성 필수
3. 실질 용역 수행 여부 소모품 구매대행, 시설 임대, 홍보 마케팅 실적 완비 실체 없이 세금계산서만 발행하는 페이퍼컴퍼니 월간 용역수행 보고서 및 작업 결과물 상시 아카이빙
4. 시설 및 장비 임대 MSO 명의 장비를 병원에 시가 임대차 계약으로 제공 비의료인이 병원 자산과 부채를 포괄 지배 공인 감정평가 및 시가 임대차 요율 준수
5. 인력 파견 및 고용 원무 행정, 홍보 전담 직원을 MSO가 적법 고용 간호사, 치위생사 등 의료 인력을 무단 도급/파견 의료인력은 병원이 직접 고용, 행정인력만 MSO 소속
6. 가족 주주 배당 배우자·자녀 주주 구성 및 연 2,000만 분리과세 배당 차명 주주를 통한 불법 리베이트 수수 창구로 악용 합법적 상속·증여세 신고 및 주주총회 결의 절차 완비
EMR 전자차트
유비케어·덴트웹 수납 연동
심평원 포털 대사
HIRA 요양급여 100% 매칭
Gross 환산 엔진
페이닥터 원천세 자동 역산
Python 기장 알고리즘
공통매입 안분 및 성실신고
실시간 의료 세무 시뮬레이터

우리 병의원의 절세 잠재력
실시간 맞춤 시뮬레이션

봉직의 Net급여 실수령액을 세전 총급여로 역산하고, 간호·치위생 인력 채용 시 3개년 누적 통합고용세액공제를 즉시 확인하세요.

CALCULATOR 01

봉직의 Net to Gross 역산기

월 실수령액(Net) 기준 병원 대납 세금 및 세전 총급여(Gross) 산출

봉직의 월 실수령액 (Net) 1,500 만원

고소득 전문직 소득세율(38~42%) 및 4대보험 본인부담금 종합 실효율 반영

신고 대상 세전 총급여 (Gross): 월 2,187 만원
병원 대납 세금 및 4대보험: 월 687 만원
연간 세전 총 인건비 예산: 연 2억 6,244 만원
CALCULATOR 02

간호·치위생 인력 통합고용세액공제

조특법 제29조의8 병의원 인력 채용 시 3개년 누적 소득세 공제액

1차년도 소득세 감면액: 4,050 만원
3개년 누적 총 세액공제: 1억 2,150 만원
CALCULATOR 03

의료장비 통합투자세액공제(조특법 제24조) 계산기

레이저, CT, MRI, 유닛체어 등 신규 의료장비 도입 시 당해 연도 세액공제 및 5개년 감가상각비 산출

장비 취득가액 (금융리스 포함) 1억 원
당해 연도 직접 세액공제: 1,000 만원
연간 감가상각비 (5년 정액): 연 2,000 만원
5년간 총 소득세 절감액: 약 5,200 만원
실제 절세 성공 사례

정평세무컨설팅과 함께한 병의원 절세 사례 연구

CASE STUDY 01

서초구 피부과 의원 A원장

미용시술 과세 매출과 질병치료 면세 매출의 안분계산 오류로 지난 2년간 부가가치세가 과다 납부된 내역을 포착. 경정청구를 통해 2,420만원을 전액 환급받고 공통매입세액 정산 체계를 확립했습니다.

성과: 부가가치세 2,420만 원 환급
CASE STUDY 02

송파구 치과의원 B원장

치과기공소 면세 계산서와 임플란트 픽스처 매입 전산 매칭을 완료하고, 청년 치위생사 3명 증원에 따른 통합고용세액공제를 적용하여 종합소득세 4,350만원을 합법적으로 절감했습니다.

성과: 종합소득세 4,350만 원 감면
CASE STUDY 03

수원 정형외과 C원장

수입금액 8억원 돌파에 대비하여 10월부터 사전 3단계 가결산을 실시. 봉직의 2명의 Net계약서를 Gross 환산 표준 양식으로 정비하여 세무조사 위험과 퇴직금 소송 리스크를 100% 차단했습니다.

성과: 성실신고 적격 판정 & 노무 방어
자가진단 체크리스트

우리 병의원은 안전한가?
의료 세무·노무 10대 리스크 자가진단

현재 병원의 운영 상태를 체크해 보세요. 국세청 전산망과 건보공단 지도점검에 대비한 위험도를 실시간으로 평가합니다.

의료기관 특화 프로젝트 및 결산 수수료 투명 공시 원칙

정평세무컨설팅 의료약학 세무본부는 5월·6월 결산 시점의 기습적인 과다 청구나 불투명한 추가 비용 요구를 일체 배제합니다.

성실신고확인 용역 (수입 5억 초과) 사업용 계좌 입출금 전수 대조, 3만원 초과 적격증빙 실사, 확인서 서명 날인에 소요되는 업무량 기준 사전 정액제 합의
개원 인테리어·의료기기 조기환급 개원 초기 원장님의 자금 유동성을 위해 정기 수임 고객 대상 추가 수수료 부담을 최소화하여 15일 이내 신속 접수
CURRENT MEDICAL RISK LEVEL
0개 항목 선택됨 - 세무 리스크 점검 전
해당하는 항목을 체크하시면 실시간으로 병원의 세무·노무 취약점을 도출합니다.
JOINT MEDICAL CLINIC & GOODWILL STRATEGY

공동개원(동업) 병의원 손익 분배 & 영업권(권리금) 정밀 평가

2인 이상 공동개원 시 지분율에 따라 각 원장님께 소득세가 안분되므로 강력한 누진세율 분산 효과를 얻을 수 있습니다. 단, 중도 탈퇴나 신규 원장 영입 시 병원 영업권(권리금) 평가와 동업계약서 공증이 선행되어야 향후 세무조사와 분쟁을 완벽히 방어할 수 있습니다.

STEP 01

지분율 세무 등록

사업자등록 시 동업계약서상 출자 비율과 손익 분배 비율을 명확히 신고하여 1인 단독 과세를 방지합니다.

STEP 02

영업권(권리금) 감정

신규 원장 입어 시 병원 초과이익력을 공인 감정평가하여 기타소득(60% 필요경비 인정, 8.8% 세율)으로 처리합니다.

STEP 03

5년 균등 감가상각

영업권을 인수한 병원은 5년간 매년 균등 감가상각비로 필요경비에 산입하여 매년 수천만 원의 소득세를 절감합니다.

STEP 04

탈퇴 채무 정산 특약

원장 탈퇴 시 금융부채 연대보증 해제 및 미지급 퇴직금 분담 특약을 공증받아 세무·법률 분쟁을 차단합니다.

PRICING POLICY & TRANSPARENCY

기장팩토리 의료 세무 수수료 산정 기준

세무사법 광고 규정을 엄격히 준수하며, 금액을 단독 노출하지 않고 업무량과 의료기관 규모에 따라 합리적으로 책정합니다.

기준 01. 수입금액 & 진료과목

연간 총 수입금액 규모, 급여/비급여 구성비, 피부·성형 등 과·면세 겸영 여부에 따른 공통매입 안분 난이도 반영.

기준 02. 의료 인력 & Net급여

봉직의(페이닥터) Net계약 인원수, 간호사·치위생사·직원 수에 따른 원천징수 Gross 환산 및 노무 관리 범위 반영.

기준 03. 성실신고 & MSO 자문

수입 5억 초과 성실신고확인 사전 3단계 실사, 의료장비 리스 세액공제, MSO 법인 설립 및 지배구조 자문 범위 반영.

세무사법 준수 필수 고지 사항

• 법인 의료기관의 기장료 및 결산 세무조정료는 병상 수, 진료과목 특수성, 회계기준에 따라 1:1 상담 후 개별 산정되므로 일률적 금액을 표기하지 않습니다.

• 개인사업자 중 연간 수입금액 5억 원을 초과하는 성실신고확인대상 병의원 및 대형 한방병원/복합 메디컬 빌딩은 전문 회계사와의 사전 진단을 거쳐 별도 협의 필요 항목으로 분류됩니다.

약국 전문 세무: 폐기의약품 손금산입 & 조제약가 분리 회계

약국은 처방전에 의한 전문의약품 조제 매출(약가마진 0원, 조제료 수수료만 매출)과 일반의약품·건강기능식품 매약 매출(마진 발생, 부가세 10% 과세)의 구조가 완전히 다릅니다.

유효기간 경과 폐기의약품 손금산입 제약사 반품 불가 폐기의약품에 대해 폐기 확인서, 사진 대장, 감가손실 입증 서류를 구비하여 법인세 및 소득세 전액 필요경비로 인정받습니다.
조제료 수입금액 검토표 정밀 매칭 건강보험심사평가원 조제료 청구 내역과 약국 청구프로그램(PM2000, 팜아이 등)의 비보험 조제 데이터를 1원 단위로 크로스체크합니다.
의료 세무 FAQ 12선

병의원·약국 원장님들이
가장 많이 묻는 실무 질문 12선

봉직의 Net급여부터 2월 사업장현황신고, 피부·성형 과면세 안분, 성실신고 대비까지 명쾌한 해답을 드립니다.

병원장이 대신 납부해 주는 근로소득세와 4대보험료는 세법상 봉직의의 근로소득(총급여)에 합산하여 원천징수 신고를 해야 합니다. 이를 누락하고 실수령액만 신고하면 원천징수불성실가산세(최고 10%)가 부과되며, 퇴직 시 세전 총급여액을 기준으로 퇴직금을 재산정해야 한다는 대법원 판례(2020다226447)가 확립되어 있어 반드시 계약서에 Gross 환산액과 연말정산 환급금 귀속 특약을 명시해야 합니다.
부가가치세법상 질병 치료 목적 진료는 면세이나, 미용·성형 목적(쌍꺼풀, 코성형, 유방확대, 지방흡입, 주름살제거, 보톡스, 필러, 제모, 레이저 색소 치료 등)은 10% 과세 대상입니다. 따라서 과세와 면세를 겸영하는 사업자로 등록하고, 임차료나 인테리어비 등 공통매입세액을 과세/면세 매출액 비율로 안분하여 부가세 확정신고 시 공제받아야 합니다.
국세청은 2월 사업장현황신고서에 기재된 의료수입금액(심평원 요양급여, 자동차보험, 비급여 등)을 심평원 전산망 및 신용카드/현금영수증 데이터와 즉시 대조합니다. 이때 수입금액을 과소 신고하거나 5월 종합소득세 신고서와 숫자가 어긋나면 사업장현황신고 불성실 가산세(0.5%)가 부과되며, 탈루 혐의 병의원으로 전산 분류되어 세무조사 우선 대상이 됩니다.
보건업(의원, 치과, 한의원)은 해당 연도 수입금액이 5억원 이상이면 성실신고확인대상자가 됩니다. 세무사는 사업용 계좌 내역, 3만원 초과 거래의 적격증빙 일치 여부, 인건비 지급 내역, 차량 유지비의 업무 관련성, 의료소모품 재고 등을 정밀 실사하여 확인서를 제출해야 합니다. 기한은 6월 30일까지입니다.
병원과 의원은 소득세법 제162조의3에 따른 현금영수증 의무발행업종입니다. 건당 거래금액이 10만원 이상이면 환자가 원치 않거나 인적사항을 밝히지 않더라도 현금 수령일로부터 5일 이내에 국세청 지정 코드(010-000-1234)로 무조건 자진발급해야 합니다. 미발급 시 해당 금액의 20%에 달하는 가산세가 부과됩니다.
조특법 제29조의8(통합고용세액공제)에 따라 전년 대비 상시근로자 수가 증가한 경우, 청년(만 15~34세) 정규직 1인당 수도권 과밀억제권역은 연 1,450만원, 지방은 연 1,550만원을 종합소득세에서 공제받을 수 있습니다. 고용을 유지할 경우 3년간 누적 적용되어 1인당 최대 4,650만원의 세금을 줄일 수 있습니다.
금융리스는 세법상 병원이 자산을 직접 소유한 것으로 보아 매년 감가상각비와 이자비용을 비용 처리하며, 조특법 제24조 통합투자세액공제(투자액의 1~10%)를 적용받을 수 있습니다. 운용리스는 월 리스료 전액을 임차료로 즉시 손금 산입할 수 있습니다. 개원 초기 소득 수준과 자금 상황에 맞추어 회계사가 최적 방식을 설계해 드립니다.
국세청은 치과기공소에서 발행한 면세 계산서 수량(보철물, 크라운, 인레이 등)과 임플란트 픽스처 매입 수량을 진료 수입과 직접 대조합니다. 기공물 매입 건수 대비 신고된 비급여 진료 매출이 비정상적으로 적으면 무자료 현금 수납을 의심하여 정밀 세무조사에 착수하므로 정밀한 원가율 분석 관리가 필수입니다.
의료법 제33조에 따라 비의료인의 의료기관 개설(사무장병원)은 엄격히 금지됩니다. 그러나 MSO 법인이 의약품 구매대행, 홍보 마케팅, 인사 컨설팅, 시설 임대 등 진료 외적인 순수 경영 지원 용역을 실제 수행하고 시가에 부합하는 정당한 대가를 수취하는 구조는 적법하며 합법적인 법인세율 분산 효과를 얻을 수 있습니다.
공동사업자 등록 시 지분 비율에 따라 종합소득세가 각 원장님께 안분 과세되므로 누진세율 분산 효과가 큽니다. 단, 동업계약서상 지분 비율, 손익 분배 기준, 중도 탈퇴 시 영업권(권리금) 평가 산정 기준, 채무 분담 특약을 사전에 명확히 공증받아야 향후 분쟁과 세무 조사를 방어할 수 있습니다.
네, 기장팩토리는 연간 결산 및 성실신고확인 비용을 월 정액 요금에 균등 분산하여 안내하는 투명 요금제를 지향하므로, 5월이나 6월 결산 시점에 기습적인 추가 청구가 발생하지 않도록 사전 견적을 투명하게 고지합니다.
원장님께서 신경 쓰실 필요가 전혀 없습니다. 홈택스에서 수임 동의 클릭 한 번만 진행해 주시면, 과거 3개년 결산서 및 감가상각명세서, 적격증빙 인수인계는 정평세무컨설팅 병의원 전담팀이 기존 대리인과 직접 연락하여 완벽하게 처리해 드립니다.
1:1 병의원·약국 전담 창구

정평세무컨설팅 실시간 원장님 상담 & B2B 제휴

병의원 원장님을 위한 빠른 간이 세무 상담과 의료기기사·제약사·병원 플랫폼 대상 B2B 업무제휴 창구가 분리 운영됩니다.

원장님·약사님 전용 직통

빠른 간이 세무 상담 신청

봉직의 Net급여, 과세/면세 안분계산, 2월 사업장현황신고, 성실신고확인 등 원장님의 병원 세무 고민을 남겨주시면 전담 회계사가 검토 후 신속히 연락드립니다.

제약·의료기기·협회 전용

B2B 공식 업무제휴 제안

의료기기 제조·리스사, EMR 솔루션 기업, 제약사, 의사회·치과의사회 대상 세무 연계 제휴를 공식 접수합니다.