정평세무컨설팅 MEDICAL CLINIC TAX CARE
MEDICAL CLINIC TAX MANAGEMENT & AUDIT SHIELD

병의원·의원·치과·한의원
비급여 매출 비율 관리부터
성실신고 사전 방어 & 정액 세무구독까지

피부과·성형외과·치과·한의원의 복잡한 비급여 매출과 건보 급여 청구 데이터 일치 검증, 봉직의(페이닥터) NET(네트제) 급여 분쟁 원천 차단, 고가 의료장비 감가상각 최적화까지. 사전 합의 없는 조정료 청구는 단 1원도 발생하지 않습니다.

0원 사전 미합의 조정료 청구
100% 성실신고 사전 스크리닝
수십억 원 의료장비 세액공제 누적
EMR 연동 기장팩토리 매출 자동 대사
CLINICAL TAX RISKS AUDIT

원장님이 진료에만 집중할 수 없는
병의원 6대 치명적 세무 리스크

의료기관은 국민건강보험공단 급여 데이터와 국세청 EMR 연계, 고소득 전문직 성실신고 타깃으로 일반 사업자와 완전히 다른 정밀 세무가 요구됩니다.

01

비급여 시술 매출 비율 불일치 및 국세청 사후검증

피부과, 성형외과, 안과, 치과, 도수치료 등 비급여 시술 비중이 높은 병의원은 국세청 통합분석시스템(TIS)상 동일 진료과 평균 매출 비율과 편차가 크면 즉각적인 해명자료 제출 요구 및 기획 세무조사의 1순위 타깃이 됩니다.

위험 결과: 5개년 비급여 매출 누락 재산정 및 부가가치세·소득세 추징
02

봉직의(페이닥터) NET(네트제) 계약 퇴직금·4대보험 분쟁

세후 실수령액을 보장하는 의료계 관행인 네트(NET) 계약을 체결했으나, 연말정산 환급금 귀속 문제, 퇴직금 산정 시 세금 대납액 포함 여부로 인해 퇴직 시 수천만 원대 노동청 진정 및 세무 원천징수 가산세 폭탄이 터집니다.

위험 결과: 원천세 수정신고 가산세(최대 10%) 및 거액의 퇴직금 소송
03

수억 원대 고가 의료기기(레이저·CT·체어) 감가상각 오류

의료장비 리스(운용리스 vs 금융리스)와 렌탈, 직접 할부 구매 시 세무상 감가상각 내용연수(5년) 적용과 감가상각방법(정률법/정액법) 선택 오류로 당해 연도 경비 인정을 제대로 받지 못하거나 세액공제가 통째로 누락됩니다.

위험 결과: 조특법 제24조 통합투자세액공제(수천만 원) 권리 박탈
04

수입금액 5억 초과 시 성실신고확인제 가산세 및 정밀 조사

보건업(의원·치과·한의원)은 연간 수입금액 5억 원 이상 시 성실신고확인 대상이 됩니다. 개인 가사경비의 사업비 오인 계상, 차량운반비 한도 초과, 상품권·복리후생비 증빙 불비 시 담당 세무대리인까지 징계를 받게 되며 세무조사로 직결됩니다.

위험 결과: 미확인 가산세 5% 부과 및 즉각적인 세무서 정밀 실사
05

의약품·임플란트·필러 리베이트 의혹 및 무자료 거래

제약사 및 의료기기 도매상과의 거래에서 제공되는 할인(할증)이나 보상금에 대해 적격 세금계산서가 수취되지 않고 세무상 매출할인 또는 잡이익으로 적법 조정되지 않으면, 조세포탈 및 리베이트 처벌 위험에 직면합니다.

위험 결과: 의료법 위반 형사고발 연계 및 법인세·소득세 손금 전액 부인
06

사전 합의 없는 결산기 기습 세무조정료 청구

매월 소정의 기장료만 납부하다가, 5월 종합소득세 및 성실신고 신고철이 되면 사전 아무런 합의도 없이 수백만 원에서 천만 원에 달하는 세무조정료 영수증을 기습 청구받아 원장님의 경영 계획을 훼손합니다.

위험 결과: 불투명한 비용 청구로 인한 세무대리인과의 신뢰 붕괴
TAILORED MEDICAL TAX SOLUTIONS

정평세무컨설팅의
병의원·의료기관 특화 6대 솔루션

EY 한영 대형 회계법인 감사본부 출신이자 코딩하는 회계사 이민우 대표의 실전 데이터 분석으로 원장님의 세무를 무결점으로 방어합니다.

비급여 매출 비율 최적화 & 소명 패키지 사전 구축

전자의무기록(EMR) 진료 차트와 카드사, 현금영수증, 계좌이체 내역을 교차 분석하여 진료과목별 적정 비급여 매출 비율을 상시 모니터링하고, 국세청 해명 요구 시 즉시 제출 가능한 입증 서류철을 사전에 완비합니다.

  • • 의약품·주사제 매입량 대사 비율 분석
  • • 미용 목적 비급여 부가세 면세/과세 완벽 분리

봉직의 NET 급여 정밀 세무 세팅 (노무 분쟁 제로)

의료계 표준 NET 근로계약서 양식을 정비하여 대납 소득세 및 4대보험의 세법상 처리 방안을 명문화하고, 퇴직금 산정 시 세금 대납액 분쟁을 사전에 완전 차단하는 적법 임금 체계를 구축합니다.

  • • 연말정산 환급금 귀속 조항 명문화
  • • 근로소득 원천세 수정신고 가산세 사전 방어

고가 의료장비 통합투자세액공제 & 감가상각 극대화

초음파, 레이저, 치과용 3D CT, 임플란트 수술 체어 취득 시 조특법 제24조 통합투자세액공제(투자액의 10% 직접 감면)를 적용하고, 상각방법 시뮬레이션으로 수천만 원의 소득세를 절감합니다.

  • • 운용리스 vs 금융리스 세무상 유불리 사전 진단
  • • 과거 5개년 누락된 세액공제 경정청구 환급

성실신고확인제 사전 모니터링 클리닉 (필요경비 100% 수호)

5월 신고 전 11월과 12월에 사전 가결산을 실시하여 수입금액 5억 초과 여부와 경비 인정률을 정밀 검토합니다. 적격 증빙 없는 비용을 사전 정비하여 6월 성실신고확인서를 무보정으로 통과시킵니다.

  • • 업무용 승용차 운행기록부 및 전용 보험 점검
  • • 학회비, 세미나비, 의학도서 구입비 적격성 입증

사전 합의 정액 세무조정료 시스템 (추가 청구 0원)

정평 스탠다드 구독 플랜은 연간 세무조정료가 기본 포함되어 있으며, 계약 체결 시점에 병의원 수입금액과 직원 수를 바탕으로 연간 총 보수를 사전 확정합니다. 결산기 깜짝 청구가 전혀 없습니다.

  • • 계약서 명시 보수 외 불투명한 추가비용 전면 배제
  • • 100% 예측 가능한 연간 병원 운영 자금 계획 수립

기장팩토리 의료기관 전산(EMR·건보공단) 자동 동기화

의사랑, 비트U차트 등 주요 EMR 청구 데이터와 국민건강보험공단 요양급여 지급 내역, 신용카드 승인 전표를 매일 새벽 API로 자동 동기화하여 수기 입력 오류와 전표 누락을 차단합니다.

  • • 본인부담금과 공단부담금 일별 자동 정산 대사
  • • 월간 병원 경영 지표(원가율, 인건비율) 리포팅
INTERACTIVE CLINICAL TAX SIMULATOR 2.0

병의원 수입금액 & 비급여 비율별
실시간 세무 자가진단 & 절세 시뮬레이터

진료과목, 연간 총 수입금액, 비급여 매출 비중, 의료장비 투자액을 입력하시면 예상 종합소득세 및 성실신고 대상 여부, 의료장비 세액공제 효과를 즉시 산출해 드립니다. (단순 참고용이며 정밀 진단이 필요합니다.)

병의원 운영 조건 입력

3. 연간 총 수입금액 (매출액) 8억 원
3억 원 15억 원 30억 원
4. 비급여 시술 매출 비중 (%) 60%
10% (보험 중심) 50% 95% (순수 비급여)
5. 당해 연도 의료장비·인테리어 신규 투자액 1억 5,000만 원
0원 5억 원 10억 원
CLINICAL TAX DIAGNOSIS 성실신고 대상 (5억 초과)
비급여 매출 사후검증 리스크 지수
주의 관리 등급 (EMR 대사 필수)

비급여 매출 60% 구간: 피부과 평균 대비 적정 범위이나 의약품 매입량과의 대사 검증이 필요합니다.

예상 종합소득세 기준액 6,400만 원
조특법 제24조 의료장비 세액공제 - 1,500만 원 (투자액 10%)
정평 사전모니터링 경비 인정 효과 - 1,200만 원 (불인정 방어)
예상 절세 & 공제 총액 약 2,700만 원 절감
병의원 비급여 세무 사전진단 신청

※ 위 계산은 소득세법 및 조세특례제한법에 기반한 시뮬레이션 추정치이며, 실제 세무 처리는 원장님의 종합소득 및 개별 경비 내역에 따라 달라질 수 있습니다.

CLINICAL ANNUAL TAX SCHEDULE

병의원 원장님이 챙겨야 할
월별 세무·노무·성실신고 캘린더

2월 사업장현황신고부터 6월 성실신고, 11월 건보료 정산까지 의료기관 고유의 세무 타임라인을 놓침 없이 케어합니다.

1분기 (1월 ~ 3월) Q1 MILESTONE
1월: 부가가치세 확정 & 간이지급명세서 미용 목적 비급여 시술(피부·성형) 부가세 확정신고 및 간호조무사·스태프 상반기 급여 명세 제출
2월: 면세사업자 사업장현황신고 (핵심) 건보공단 급여 매출과 비급여 수입금액, 의료기기·의약품 매입액 명세서 제출 (성실신고 1차 관문)
3월: 페이닥터 연말정산 & 법인세 봉직의 NET 계약 연말정산 확정 및 의료법인 12월말 결산 법인세 신고 마감
2분기 (4월 ~ 6월) Q2 MILESTONE
4월: 건강보험료 직장가입자 정산 전년도 확정 보수총액에 따른 페이닥터 및 직원 4대보험료 정산액 분할 납부 처리
5월: 일반 종합소득세 신고 수입금액 5억 원 미만 신규 개원 의원 종합소득세 신고 및 감가상각비 계상
6월: 성실신고확인 종합소득세 (핵심) 5억 초과 병의원 성실신고확인서 첨부 신고 (신고기한 6월 30일까지 1개월 연장 및 세액공제 적용)
3분기 (7월 ~ 9월) Q3 MILESTONE
7월: 1기 부가가치세 확정신고 피부·성형 비급여 미용 시술 상반기 과세 매출액 확정 및 조기환급 검토
8월: 주민세 사업소분 신고 병의원 사업장 연면적 330㎡ 초과 시 주민세 사업소분 자진 신고 및 납부
9월: 상반기 경영 가결산 브리핑 1~8월 누적 진료 수입 대사, 하반기 의료기기 추가 도입 시 세액공제 시뮬레이션
4분기 (10월 ~ 12월) Q4 MILESTONE
10월: 2기 부가가치세 예정신고 고가 레이저 장비 취득에 따른 시설투자 감가상각 부가세 조기환급 신청
11월: 종합소득세 중간예납 납부 직전연도 산출세액의 50% 분납 처리 및 원장님 개인 건보료 정산액 조정
12월: 성실신고 사전 모니터링 클리닉 연간 수입금액 마감 점검, 미지급금 및 가사용 경비 정리, 적격 증빙 전수 검수 완료
PROVEN MEDICAL TRACK RECORD

정평세무컨설팅이 입증한
병의원·의료기관 실제 자문 사례 5선

치밀한 데이터 분석과 법률적 소명으로 국세청 사후검증과 세무 리스크를 성공적으로 방어한 실전 사례입니다.

01

강남 피부과 A의원 : 비급여 레이저 시술 매출 12억 국세청 소명 요구 무혐의 종결

진료과목: 피부과 전문의원
[과세 쟁점]

레이저 팁 소모품 매입액 대비 신고된 비급여 시술 매출액 비율이 강남구 평균보다 낮다는 이유로 관할 세무서로부터 12억 원 규모의 매출 누락 혐의 해명 통지 수령.

[정평 솔루션]

EMR 시술 샷 수 로그와 실제 환자별 차트 기록, 장비 테스트 및 폐기된 불량 팁 수불대장을 100% 매칭하여 소명서 작성 및 전담 회계사 입회 하에 소명 브리핑 실시.

[최종 성과]

국세청 사후검증 무혐의 통지 수령 완료. 과소신고 가산세 0원 처리 및 세무조사 전환 원천 차단 성공.

02

서초 성형외과 B의원 : 봉직의 4명 NET 급여 분쟁 방어 및 원천세 가산세 4,800만 원 차단

진료과목: 성형외과의원
[과세 쟁점]

퇴사한 봉직의가 세후 네트제 급여에서 발생한 연말정산 환급금 반환 및 대납 세금을 포함한 퇴직금 재산정을 요구하며 노동청 진정 및 국세청 탈세 제보 위협.

[정평 솔루션]

계약 체결 당시의 교섭 이력과 대납 세액 귀속 합의 문건을 법리 검토하여 대납액의 근로소득 원천징수 정당성을 입증하고 신속한 삼자 합의서 체결 주도.

[최종 성과]

노동청 진정 취하 및 원천징수불성실 가산세 4,800만 원 사전 차단, 병원 표준 네트제 근로계약 전면 개정 완료.

03

송파 치과 C의원 : 3D CT 및 수술 체어 4.5억 리스 통합투자세액공제 4,500만 원 환급

진료과목: 치과의원 (임플란트)
[과세 쟁점]

개원 시 도입한 4.5억 원 상당의 의료설비가 금융리스라는 이유로 기존 세무대리인이 세액공제 대상이 아니라고 오판하여 공제를 통째로 누락.

[정평 솔루션]

조세특례제한법 제24조 및 대법원 판례에 따라 금융리스 자산의 세법상 취득자 실질을 소명하고, 과거 3개년 종합소득세 경정청구를 전격 제기.

[최종 성과]

국세청 경정청구 승인으로 기납부 종합소득세 4,500만 원 현금 환급 수령 및 향후 5개년 감가상각비 정상 복구.

04

마포 한의원 D원장 : 자보·첩약 비급여 매출 성실신고 사전 클린시트로 가산세 0원 달성

진료과목: 한의원 (교통사고·다이어트)
[과세 쟁점]

자동차보험 진료비와 다이어트 환 비급여 수입이 급증하여 연매출 7억 원으로 최초 성실신고 대상에 진입했으나 원외탕전비 증빙 불비로 가산세 위험 노출.

[정평 솔루션]

11월 조기 결산 클리닉을 가동하여 약재 매입 세금계산서와 탕전 처방 내역을 1:1 대사하고, 가사용 경비를 선제적으로 발라내어 무결점 성실신고확인서 작성.

[최종 성과]

세무서 성실신고 전산 분석 100점 통과, 성실신고확인비용 세액공제(120만 원) 및 의료비 공제 전액 수혜.

05

경기 분당 정형외과 E의원 : 도수치료 비급여 소명 및 정액제 구독 전환으로 연간 수수료 40% 절감

진료과목: 정형외과·통증의학과
[과세 쟁점]

도수치료 물리치료사 인센티브 3.3% 원천징수와 관련한 세무서 실사 위협 및 매년 5월마다 800만 원씩 청구되는 불투명한 세무조정료로 극심한 스트레스.

[정평 솔루션]

물리치료사 근로 형태를 적법 근로계약으로 전환하고 고용증대세액공제를 신규 적용, 정평 스탠다드 구독 플랜으로 사전 합의된 정액 조정료 확정.

[최종 성과]

연간 세무 비용 40% 이상 절감, 고용증대세액공제로 3년간 4,200만 원 추가 세액 감면 혜택 획득.

DATA PIPELINE ARCHITECTURE

의료 전산과 홈택스의 완벽한 결합
기장팩토리 병의원 데이터 자동화 파이프라인

정평세무컨설팅의 독자적인 기장팩토리 엔진은 수작업 전표 입력의 한계를 극복하고 의료기관 고유의 회계를 24시간 실시간 동기화합니다.

01

EMR & 건보공단 급여 데이터 API 연동

건강보험공단 요양급여 청구·지급 내역과 신용카드 단말기, 현금영수증 매출을 256비트 금융 보안 프로토콜로 실시간 스크래핑하여 단 1원의 누락도 방지합니다.

  • • 본인부담금/공단부담금 일별 정산 대사
  • • 미용 비급여 부가세 과세/면세 자동 분리
02

AI 의료 계정 분류 및 CPA 이중 감사

의약품 매입, 의료소모품, 장비 리스료, 세탁비, 학회 등록비를 머신러닝이 1차 분류하고, 이민우 대표 공인회계사가 직접 세법상 적격성을 2차 검수합니다.

  • • 99.8% 이상의 계정코드 자동 매칭 정밀도
  • • 의약품 수불부 연계 사후검증 리스크 차단
03

카카오톡 & 슬랙 월간 원장 경영 리포트

난해한 결산서 대신, 원장님이 한눈에 파악할 수 있는 진료과목별 원가율, 봉직의 인건비 비중, 5월 예상 소득세를 스마트폰으로 다이렉트 브리핑합니다.

  • • 성실신고 기준 도달 전 사전 경고 알림
  • • 카카오톡 1:1 회계사 직통 자문 채널 운영
TRANSPARENT FEE POLICY

투명하고 합리적인
병의원 세무 보수 산정 기준

정평세무컨설팅은 세무사법 광고 규정을 철저히 준수합니다. 근거 없는 미끼성 저가를 배제하고, 진료과목, 수입금액 규모, 봉직의 및 스태프 인원, 전표 수량에 기초한 객관적 기준에 따라 계약 시점에 사전 합의합니다.

개원의 기본형

1인 의원·신규 개원 클리닉

연 매출 3억 원 미만, 봉직의가 없고 상시 근로자 2인 이하의 초기 개인 의원 및 치과·한의원을 위한 표준 기장 관리 서비스입니다.

산정 기준 및 범위:
  • • 2월 면세사업자 사업장현황신고 대행
  • • 5월 일반 종합소득세 표준 장부 작성
  • • 직원 4대보험 취득·상실 및 원천세 관리
  • • 홈택스 세금계산서·카드 매입매출 자동 수집
※ 산정 기준 요건 충족 시 협의 후 수임 확정
수임 요건 문의하기
RECOMMENDED
정평 스탠다드 구독 플랜

비급여 전문 클리닉 & 성실신고 의원

연 매출 5억 원 이상 성실신고 대상이거나 피부과, 성형외과, 치과, 도수치료 비급여 매출이 발생하는 의료기관을 위한 전담 케어 플랜입니다.

산정 기준 및 포함 혜택:
  • 연간 세무조정료 기본 포함 (사전 합의 정액제)
  • • 성실신고확인제 사전 모니터링 클리닉 및 소명 준비
  • • 봉직의 NET(네트제) 근로계약 원천세 정밀 세팅
  • • 의료기기 통합투자세액공제(10%) 상시 반영
  • • EMR 연동 비급여 매출 비율 상시 모니터링
※ 계약 시점 사전 합의로 연간 총 수수료 100% 예측 가능
스탠다드 구독 문의하기
의료법인 & 대형병원

병원급 의료기관·공동개원 네트워크

병원급(30병상 이상), 의료법인, 프랜차이즈 지점 네트워크, 주식 소각 및 감자, MSO(병원경영지원회사) 설립 연계 자문입니다. (법인사업자 대상 일률적 가격 노출 금지 준수)

포함 전문 서비스:
  • • MSO 지분 구조 설계 및 일감몰아주기 방어
  • • 공동대표 지분 정산 및 동업 탈퇴 세무 조정
  • • 대형 의료장비 리스 자산재평가 및 감사 대비
  • • 국세청 기획조사 및 조세불복 전담팀 가동
영세 범위를 초과하는 법인 및 특수 케이스는 별도 협의 필요
의료 전담 회계사 1:1 상담
SECURE INQUIRY PIPELINE

병의원 세무 진단 및 제휴 신청
실시간 백그라운드 자동 접수

진료 및 수술 일정으로 바쁘신 원장님을 위해 온라인 간이 접수 창구를 운영합니다. 전문 공인회계사가 내용을 사전 검토한 후 즉시 연락드립니다.

빠른 간이 세무 상담 신청

의원, 치과, 피부과, 성형외과, 한의원 원장님 전담 창구

원장님의 개인정보 및 의료기관 정보는 의료법 및 개인정보보호법에 따라 비밀이 철저히 보장됩니다.

B2B 공식 업무제휴 제안

의료기기사, 제약사, EMR 플랫폼, 의사회/치과의사회 제휴

제출 완료 시 구글 폼즈 데이터베이스로 안전하게 자동 동기화됩니다.

CLINICAL DEPARTMENT TAX MATRIX

진료과목별 비급여 세무 쟁점 &
국세청 중점 조사 포인트 비교표

진료과목마다 수익 구조와 비급여 비율, 매입 품목이 완전히 다릅니다. 원장님의 진료과목에 특화된 정밀 세무 체크포인트를 확인하세요.

진료과목 평균 비급여 비중 주요 세무조사 리스크 핵심 적격증빙 매칭 정평 특화 절세 솔루션
피부과 / 성형외과 레이저, 쁘띠, 안티에이징 75% ~ 95% 소모품(팁, 필러, 보톡스) 매입 대비 시술 매출 누락 추정, 현금 할인 결제 유도 탈세 제보 레이저 샷 수 로그 및 불량 소모품 폐기 수불부 EMR 실시간 대사 & 미용 부가세 과세/면세 완벽 분리
치과 의원 임플란트, 교정, 보철 45% ~ 70% 기공소 전자계산서 수취 누락, 임플란트 픽스처 패키지 할인 매출 누락, 치아미백 부가세 신고 누락 기공물 의뢰서 및 골드·픽스처 재고 수불대장 3D CT·체어 통합투자세액공제 & 골드 폐금 정산 자문
정형외과 / 통증의학과 도수치료, 체외충격파, 신경차단술 40% ~ 65% 도수치료 실손보험 과다 청구 기획 조사, 물리치료사 3.3% 프리랜서 인센티브 원천징수 불일치 물리치료사 근로계약서 및 도수치료 처방전 도수치료 합법적 인센티브 설계 & 성실신고 사전 방어
한의원 / 한방병원 첩약, 추나요법, 자동차보험 30% ~ 55% 원외탕전원 약재 매입 계산서 불비, 다이어트 한약 비급여 현금 결제 누락, 자보 청구액 차이 원외탕전 처방전 및 녹용·인삼 등 한약재 수불부 자보 확정 수입액 자동 매칭 & 원외탕전비 적격 처리
안과 의원 라식·라섹, 백내장 다초점 렌즈 50% ~ 80% 백내장 다초점 인공수정체 렌즈 매입량 대사, 실손보험 연계 비급여 검사비 집중 세무조사 인공수정체 렌즈 수불부 및 수술실 수술 기록지 라식 장비 가속상각 & 백내장 수기 전표 EMR 자동 검증
내과 / 이비인후과 / 소청과 만성질환, 수액클리닉, 비급여 검사 15% ~ 35% 면역 수액·영양제 현금 결제 매출 누락, 알레르기 비급여 검사비 정산 불일치, 백신 폐기분 소명 수액 주사제 입출고장 및 백신 콜드체인 수불 대장 건보 공단부담금 실시간 대사 & 수액제 원가율 세무 관리
※ 정평세무컨설팅은 진료과목별 표준 비급여 지표를 자체 보유하여 세무서 조사관의 분석 알고리즘보다 앞서 리스크를 차단합니다. 진료과목별 맞춤 상담 신청하기 →
MEDICAL AUDIT CHECKLIST

성장 단계별 병의원
필수 세무·노무·성실신고 체크리스트

개원 준비부터 페이닥터 채용, 성실신고 진입, 공동개원 및 병원 확장까지 반드시 점검해야 할 핵심 마일스톤입니다.

STAGE 01. 개원 준비 OPENING
  • 보건소 의료기관 개설신고 및 면세/겸영 사업자등록증 발급
  • 인테리어 공사비 세금계산서 및 감가상각 자산 등록 적격성 점검
  • 초기 의료기기(레이저·CT) 리스(운용 vs 금융) 세무 구조 확정
  • 사업용계좌 개설 신고 및 신용카드 가맹점 국세청 연동
STAGE 02. 봉직의 채용 STAFFING
  • 봉직의(페이닥터) NET(네트제) 근로계약서 세무 조항 법률 감수
  • 대납 세액 및 4대보험의 근로소득 원천징수 가산세 사전 방어
  • 간호사·스태프 청년 일자리 도약장려금 및 고용증대세액공제 매핑
  • 연말정산 환급금 귀속 및 퇴직금 적립 규정 노무 정비
STAGE 03. 성실신고 진입 REVENUE 5억+
  • 연간 수입금액 5억 원 초과 전 EMR 비급여 매출 비율 정밀 분석
  • 가사용 경비 선제적 발라내기 및 업무용 승용차 운행기록부 구비
  • 의약품 및 의료소모품 매입 수불대장 적격 증빙 전수 대사
  • 성실신고확인비용 세액공제(120만 원) 및 의료비·교육비 공제 수혜
STAGE 04. 확장·법인전환 EXPANSION
  • 공동개원 손익분배비율 설정 및 공동사업자 등록 정밀 자문
  • MSO(병원경영지원회사) 설립을 통한 소득 분산 및 자금 조달
  • 법인 주식 소각 및 자본 감소(감자) 세무 전략 합법 실행
  • 과거 5개년 비급여 매출 사후검증 및 세무조사 리스크 영구 차단
CLINICAL TAX GLOSSARY

원장님이 반드시 숙지해야 할
병의원 핵심 세무·법률 개념 6선

세무서 조사관과 대화할 때 무기가 되는 핵심 의료 세법 개념을 명확하게 정리해 드립니다.

TERM 01

성실신고확인제도 (소득세법 제70조의2)

의원·치과·한의원 등 보건업의 연간 총 수입금액이 5억 원 이상인 경우, 종합소득세 신고 시 장부 기재 내역의 정확성을 세무대리인에게 확인받아 확인서를 제출하는 법정 제도입니다.

TERM 02

NET(네트) 계약 & 그로스업(Gross-up)

봉직의에게 세후 실수령액을 보장하고 근로소득세 및 4대보험 본인부담금을 병원장이 대납하는 계약 형태로, 세법상 정당한 처리를 위해서는 대납액을 급여로 역산(Gross-up) 신고해야 합니다.

TERM 03

면세사업자 사업장현황신고 (소득세법 제78조)

부가가치세가 면제되는 의료업자가 매년 2월 10일까지 직전연도 수입금액과 의약품·의료기기 매입액, 시설 규모, 봉직의 인원을 세무서에 보고하는 신고로 5월 종합소득세의 기준선이 됩니다.

TERM 04

미용 목적 비급여 부가가치세 과세 (부가세법 시행령 제35조)

쌍꺼풀, 코성형, 지방흡입, 보톡스, 필러, 치아미백 등 미용 목적 시술은 의료 용역이라도 부가가치세 10% 과세 대상이며, 이를 면세로 변칙 신고하면 무거운 가산세가 부과됩니다.

TERM 05

의료기기 통합투자세액공제 (조특법 제24조)

의료기관이 진료 및 검사를 위해 취득하는 사업용 의료장비(레이저기기, 체어, CT, 초음파 등) 투자금액의 10%를 당해 연도 종합소득세에서 세액공제(10년간 이월공제)해 주는 혜택입니다.

TERM 06

MSO (Management Service Organization)

의료법상 1인 1개소 법률을 준수하면서 병원의 마케팅, 구매 대행, 시설 관리, 인사 노무를 전담하는 병원경영지원회사로, 합법적인 세무 구조 설계를 통해 누진세율을 분산합니다.

CLINICAL DOCUMENTATION PROTOCOL

성실신고 & 세무조사 완전 방어를 위한
5대 필수 의료 증빙 보관 매뉴얼

세무서 사후검증 시 단 1건의 소명 트집도 잡히지 않도록 정평세무컨설팅이 사전에 완비해 드리는 필수 증빙 체계입니다.

DOC 01

EMR 진료차트 & 수탁검사서

환자 진료 기록, 시술 샷 수, 외부 임상병리 수탁검사 의뢰서 및 검사 결과지 데이터 백업

DOC 02

의약품·소모품 거래명세서

제약사 및 재료상 전자세금계산서와 일치하는 의약품 수불부, 보톡스·필러 로트번호 수기부

DOC 03

의료장비 리스·취득 계약서

금융/운용리스 상환 스케줄표, 취득세 납부영수증, 장비 시리얼번호 및 설치 확인서철

DOC 04

봉직의 NET 표준계약서

세후 실수령액, 대납 세금의 귀속, 연말정산 환급금 및 퇴직금 정산 합의서 날인 정본

DOC 05

업무용차량 운행일지 & 보험

임직원 전용 자동차보험 가입 증명서 및 GPS 연동 업무용 승용차 주행 기록부 원본

FREQUENTLY ASKED QUESTIONS

병의원 원장님이 자주 묻는
의료 세무 실무 질문 20선

소득세법, 부가가치세법 및 국세청 예규·판례에 기반한 정확하고 신뢰할 수 있는 가이드를 드립니다.

부가가치세법 시행령 제35조에 따라 국민건강보험 요양급여 대상이 아닌 미용·성형 목적의 시술(쌍꺼풀수술, 코성형, 유방확대·축소술, 주름살제거술, 보톡스·필러 시술, 레이저 제모, 치아미백 등)은 10% 부가가치세 과세 대상입니다. 반면 여드름 치료라도 염증성 낭포 치료 등 질병 치료 목적이 명확한 경우나 턱관절 장애 치료, 시력 교정술 등은 면세 대상입니다. 정평은 EMR 차트와 연동하여 과세/면세를 명확히 구분하여 가산세를 사전 차단합니다.

국세청은 관할 지역 내 동일 진료과목의 평균 비급여 비율 및 의약품·소모품(보톡스, 필러, 실리콘, 임플란트 픽스처) 매입량과 EMR 진료 차트를 전산 대사하여 사후검증을 실시합니다. 소명 시에는 단순히 억울함을 호소하는 것이 아니라, 폐기된 약품 수불부, 원내 직원 교육 및 무상 시연 테스트분, 장비 점검 샷 수 로그 등 객관적이고 반박 불가능한 정량 데이터를 제출해야 무혐의 종결을 이끌어낼 수 있습니다.

네트제 계약 시 가장 큰 분쟁은 '연말정산 환급금의 귀속'과 '퇴직금 산정 시 세금 대납액 포함 여부'입니다. 원장님이 세금을 대납했으므로 연말정산 환급금은 병원에 귀속된다는 조항을 명문화해야 하며, 퇴직금 분쟁을 예방하기 위해 세법상 세금을 역산(Gross-up)한 세전 금액을 기준으로 적격 퇴직연금(DC형)을 가입하거나 근로계약서에 대납액의 퇴직금 산입 범위를 명확히 규정해야 노동청 진정과 가산세 위험을 방지할 수 있습니다.

네, 인정받을 수 있습니다. 세법상 병원장이 대신 납부해 준 봉직의의 소득세와 4대보험 본인부담금은 봉직의에 대한 추가적인 근로소득(급여의 일부)으로 인정됩니다. 따라서 세무서에 매월 원천징수 이행상황신고를 할 때 해당 대납액을 합산하여 '세전 급여(Gross)'로 신고하고 근로소득세를 적법하게 원천징수 납부해야만 병원의 정당한 인건비 경비로 100% 인정받을 수 있습니다.

네, 강력한 혜택이 적용됩니다. 조세특례제한법 제24조에 따른 '통합투자세액공제'는 의원급 의료기관이 진료에 직접 사용하는 사업용 의료장비를 신규 취득할 경우 기본공제 10%(투자 증가분 추가공제 최대 10%)를 종합소득세 산출세액에서 전액 감면해 줍니다. 당해 연도 납부할 세금이 적어 다 공제받지 못한 금액은 향후 10년간 이월공제가 가능합니다.

운용리스는 매월 납부하는 리스료 전액이 즉시 임차료(필요경비)로 손금 산입되는 장점이 있습니다. 반면 금융리스(또는 직접 취득/할부)는 의료기관이 자산으로 등재하여 내용연수 5년 동안 감가상각비를 계상하면서, 동시에 취득 가액의 10%에 달하는 '통합투자세액공제'를 직접 누릴 수 있습니다. 수입금액 규모와 당해 연도 예상 이익률에 따라 정평이 정밀 시뮬레이션을 거쳐 최적의 방안을 제시합니다.

그렇습니다. 소득세법 시행령 제133조에 따라 보건업(의원, 치과, 한의원)은 해당 과세기간의 총 수입금액(건보공단 요양급여 + 비급여 매출 + 자동차보험 + 판매 장려금 등 일체 합산)이 5억 원 이상이면 의무적으로 성실신고확인 대상이 됩니다. 성실신고 대상이 되면 세무사나 공인회계사에게 확인서를 받아 6월 30일까지 제출해야 하며, 미제출 시 산출세액의 5% 가산세와 세무조사 우선 선정의 불이익을 받습니다.

1순위는 '개인 가사 경비의 사업비 변칙 계상'입니다. 원장님 및 가족의 개인적 신용카드 사용액(백화점, 해외여행, 마트, 자녀 학원비), 2순위는 '업무용 승용차' 관련 비용(전용 보험 미가입, 운행기록부 미작성), 3순위는 '상품권 구입비 및 복리후생비', 4순위는 '적격증빙 없는 외주용역비'입니다. 정평은 11월 사전 가결산을 통해 문제 소지가 있는 전표를 선제적으로 완벽히 정리합니다.

약품 대금 조기 결제에 따른 대금결제 조건 할인(금융비용 할인)이나 구매 수량에 따른 단가 인하는 거래명세서와 세금계산서 상에 '매출할인' 또는 '에누리'로 적법하게 반영되어 공급가액이 감액되어야 합니다. 만약 세금계산서는 정가로 발행받고 차액을 현금이나 상품권, 법인 통장으로 별도 페이백 받는 형태는 리베이트로 간주되어 의료법 위반 및 세무조사 추징 대상이 되므로 투명한 정산이 필수적입니다.

공동 개원은 소득세법 제43조에 따라 병원의 순이익을 약정된 지분율(손익분배비율)대로 원장별로 분배한 뒤, 각자 별도로 누진세율(6~45%)을 적용받으므로 1인 단독 개원 대비 소득세 과표가 분산되어 수천만 원의 절세 효과가 발생합니다. 단, 공동사업장 합산과세 규정에 걸리지 않도록 특수관계인(부부, 직계존비속) 간의 공동개원 시에는 실질 동업 증빙을 철저히 갖추어야 합니다.

합법적이고 실질이 있는 MSO는 마케팅, 구매 대행, 시설 임대, 인사 관리 용역을 수행하고 병원으로부터 정당한 대가를 수취함으로써 고소득 원장님의 개인소득세(최고 45%)를 법인세(9~19%) 구간으로 분산하는 탁월한 효과가 있습니다. 다만, 실제 용역 제공 없이 서류상으로만 수수료를 과다 지급하면 국세청으로부터 '부당행위계산부인' 처분을 받아 법인세와 소득세를 모두 추징당하므로 정평의 엄격한 컴플라이언스 설계가 수반되어야 합니다.

자가 건물이거나 임차 건물 인테리어 공사비는 세법상 '시설구축물' 또는 '임차자산개수비(비품)'로 계상되어 통상 내용연수 5년 동안 매년 균등하게 감가상각비를 통해 필요경비로 손금 산입됩니다. 만약 임대차 기간이 만료되어 원상복구 후 퇴거하는 경우에는 잔존 미상각 장부가액을 당해 연도에 '폐기손실'로 일시에 전액 경비 처리할 수 있습니다.

실제 출퇴근 시간이 지정되어 있고 원장님의 지휘·감독을 받으며 진료를 수행한 봉직의는 계약서 명칭이 3.3% 사업소득 계약이라 하더라도 근로기준법상 근로자로 판정됩니다. 이 경우 퇴직금을 지급해야 할 뿐만 아니라 과거 3.3%로 잘못 신고한 기간에 대한 근로소득세 원천징수 불성실 가산세와 4대보험료를 소급 추징당합니다. 따라서 봉직의는 처음부터 적격 근로계약으로 관리해야 합니다.

네, 명백한 사실입니다. 정평세무컨설팅은 결산기마다 수백만 원씩 일방적으로 청구되는 불투명한 조정료 관행을 철폐했습니다. 스탠다드 플랜 계약 시 병의원의 전년도 매출액과 직원 수를 객관적으로 반영하여 연간 세무조정료가 포함된 고정 월 구독료를 사전 확정합니다. 계약에 없는 숨겨진 추가 청구는 단 1원도 없습니다.

의원 내에서 보험 진료(면세)와 피부 미용 시술(과세)을 함께 영위하는 경우 세법상 '겸영사업자'가 됩니다. 병원 공통 경비(임대료, 전기료, 공용 인테리어, 리셉션 인건비 등)에 대한 매입세액은 당해 과세기간의 면세 수입금액과 과세 수입금액의 비율대로 안분 계산하여 과세 비율에 해당하는 금액만 매입세액 공제를 받아야 세무조사 추징을 예방할 수 있습니다.

개인 병의원 원장님 본인을 피보험자로 하는 보험료는 세법상 가사경비로 분류되어 병원의 사업상 필요경비로 일체 인정되지 않습니다. 다만, 직원이나 봉직의를 피보험자로 하는 단체순수보장성보험(연 70만 원 한도) 등은 복리후생비로 경비 인정이 가능합니다. 무리한 보험 가입을 경비 처리하도록 유도하는 부실 컨설팅을 경계하셔야 합니다.

자동차보험 및 산재보험 진료비는 국민건강보험 요양급여와 마찬가지로 부가가치세 면세 대상입니다. 종합소득세 신고 시에는 보험회사나 근로복지공단에서 실제로 병원 통장에 입금된 금액 기준이 아니라, 해당 과세기간에 진료가 완료되어 청구한 '진료비 확정 총액(미수금 포함)'을 기준으로 수입금액에 반영해야 매출 누락 가산세를 피할 수 있습니다.

치과기공소에서 제작되는 보철물은 부가가치세법상 부가가치세가 면제되는 면세 용역에 해당하므로, 세금계산서가 아닌 '전자계산서'를 수취해야 합니다. 기공료 지급 내역은 치과 병의원의 가장 핵심적인 원가 항목 중 하나이므로 매월 수취한 계산서 금액과 기공 대장 및 대금 결제 내역이 완벽히 일치하도록 기장팩토리에서 교차 대사합니다.

소득세법 시행령 제67조에 따라 취득가액이 거래 단위별로 100만 원 이하인 소액 자산은 취득한 당해 연도의 전액 소모품비(즉시상각의제)로 필요경비 산입이 가능합니다. 또한 단말기, 컴퓨터, 소프트웨어 라이선스 등도 100만 원 이하 기준을 충족하면 복잡한 감가상각 없이 당해 연도 소득세를 즉시 낮추는 비용으로 활용할 수 있습니다.

온라인 간이 상담 폼이나 카카오톡, 전화를 통해 병의원 기본 정보(진료과목, 수입금액, 봉직의 수)를 남겨주시면, 이민우 대표 공인회계사가 1차 서면 검토 후 직접 상담을 진행합니다. 맞춤형 연간 보수 사전 합의 후 홈택스 수임 동의가 완료되면 기장팩토리 보안 API를 통해 건강보험공단, 여신협회, EMR 데이터를 즉시 연결하여 무결점 세무 케어가 시작됩니다.

의료법 제27조 제3항(환자 유인·알선 행위 금지)에 위배되지 않는 합법적인 비급여 할인이라 하더라도, 세법상으로는 '정상가'가 아닌 '실제 결제받은 할인 금액'을 기준으로 카드 매출 전표와 현금영수증이 발행되어야 합니다. 또한 원내 프로모션 안내문, 환자 동의서, 차트상 할인 사유 기록을 철저히 보관해야 차후 세무서에서 정상가 대비 할인 차액을 매출 누락으로 의심하여 과세표준을 임의 증액하는 것을 완벽히 방어할 수 있습니다.